- 反向折叠法的优点在于它假设蛋白质折叠类型是无限的。
- 分子对接在酶学研究以及药物设计中具有十分重要的意义。
- 计算机辅助药物设计是以量子力学和分子力学的分子模拟理论为基础，通过模拟、计算或模型学习，预测药物与靶标分子之间的作用，筛选、设计和优化先导化合物的方法。
- 在得到的药效特征数目可能会非常庞大，要想得到合理的药效团，就需要对这些特征进行简化，找出主要的药效特征，实现药效特征简化所采用的方法是聚类分析。
- Y随机检验，将响应值如生物活性随机打乱顺序，而保持描述符的顺序不变，从而建立新的QSAR模型。
- 疏水基团一般由极性原子组成，有疏水相互的片段很多，如甲基、乙基、苯环等。
- Out-of-train（OOT法）和Bootstrapping的区别在于，在抽取M个化合物作为测试集后，OOT会随机在N-M个化合物中选择一些化合物进行重复以保证训练集化合物数目保持不变，而不是用N-M个化合物直接建立QSAR模型并进行活性预测。
- 在开始构建模型，第一步就是要选择目标化合物分子，构建一个数据库。
- 最小抑菌浓度（ MIC）指在体外培养细菌8~12小时后能一直培养基内病原菌生长的最低药物浓度。
- 当涉及多个因变量时，对每个目标属性分别建立一个QSAR方程，系数可以不关联。
- 广义来讲，任何带有孤对电子的原子，如氮、氧、氟、硫等，都可以作为氢键受体。
- 下述哪些说法不正确
- 药效团的构建是基于训练集实施的，以下哪些方法适用于药效团构建
- 分子对接方法分子碎片法可分为以下哪两种
- 内部检验的方法有
- 分子对接计算的注意点
- QSAR模型的内部验证交互检验除了随机模型检验法，还有以下哪些方法
- 下列哪些是QSAR常用的参数
- 基于受体结构的药效团主要在配体-受体复合物的晶体结构已经清楚地条件下使用，其操作方法中，第一步是
- 分子对接分类中适合处理大分子和小分子间对接的是
- 药效团模型中，不同颜色的球代表不同的药效特征元素，其中芳环中心的颜色是
- 以下属于药效团中的特征元素的是
- 分子对接的基本类型除了整体分子对接法，还有
- 同源模建的可行性在于：同源蛋白是由（）由同一祖先蛋白趋异进化而产生的蛋白质。
- 计算机辅助药物设计的英文简称是什么
- 阿司匹林可用于缓解
- 分子对接属于什么领域
- Y随机检验中，
- 把两个以上字符序列对齐，逐列比较其字符的异同，使得每一列字符尽可能一致，以发现其共同的结构特征的方法称为（）。
- 测试集方法的代价是要减少一部分训练数据。
- 只有当两个蛋白质在进化关系上具有共同的祖先时，才可称它们为同源的。
- 新药的研究有三个决定阶段中，计算机辅助药物设计的主要任务就是新药物的优化研究。
- Y随机检验是检验模型是否存在偶然相关的有力工具。
- 内部验证首先是从研究的化合物中挑选出具有合理特征和数量的化合物组成训练集training set，用来建立模型。其次是确定内部验证的方法学。
- 药效团的识别方法之一：在受体结构未知或者在作用机制不明确的情况下，对一系列化合物进行(结构-活性)研究，得到一些对化合物活性至关重要的原子、基团或化学功能结构、以及其空间关系
- 期望值e描述搜索某一特定数据库时，随机出现的匹配序列数目。
- 序列比对的结果并不能作为两者之间一定存在同源关系的依据。
- 建立一个QSAR模型包括以下几个环节：准备数据库和参数----QSAR模型的内部验证----建立QSAR模型---- QSAR模型的外部验证--- QSAR模型解释
- 药效特征元素是指活性化合物所特有的，对化合物的活性有重要影响的一组原子(团)。
- 均方根误差是一种常用的测量数值之间差异的量度，其数值常为模型预测的量或是被观察到的估计量。
- 非常相关的蛋白，其二级结构单元，比如alpha-helix, beta-strand占据了整个蛋白家族的同样的相对位置。
- 全局比对是指将参与比对的两条序列里面的所有字符进行比对。
- 基于受体结构的药效团操作步骤有(受体结构的输入及活性位点), 活性位点扫描和药效特征的产生, (药效特征的聚类), 药效团的修正以及数据库搜索
- 分子对接是基于受体结构进行的药物设计,其具体应用有
- 计算机辅助药物设计方法大体可分为
- 下面属于药效团模型中正电荷中心的是
- 下列有关筛选模型的描述是正确的有：
- 4D-QSAR与5维、6维定量构效关系的区别在于其没有考虑：
- AutoDock的优点
- QSAR模型的内部验证方法包括
- 分子对接的基本步骤
- CoMSIA分子场的计算采用哪几种不同的相似性场计算
- 在操作分子对接的过程中，活性位点的确定方法有：
- 分子对接的种类主要包括
- 分子对接的主要问题
- 与药物研究相关的主要有_____，这些信息最主要的组织和管理方式就是数据库。
- 序列比较时，两个蛋白质具有的性质包括以下几点
- 序列比对实际上是根据特定数学模型找出序列之间最大匹配（）。
- 地西泮不具有下列哪项作用
- 在药效团模型方法中，芳环需要以下哪些参量来定义
- 在一般的药效团模型方法中(Discovery Studio, Catalyst)，仅仅只考虑药物分子中最常见的氢键受体形式，以下属于氢键受体形式的是
- 下列哪项属于交互检验的方法
- 活性被抑制50%时抑制剂的浓度
- 关于药效团的描述以下哪个是正确的
- 以下可以用于药效团模型建立的生物活性单位的是
- 小分子药效团模建的基本操作顺序是：
- 在体外培养细菌18~24小时后能一直培养基内病原菌生长的最低药物浓度,是
- 蛋白质的（）在很大程度上决定了蛋白质的功能，如果有了结构，我们可以用来预测其功能，以及基于结构的药物设计。
- 实现药效特征简化所采用的方法是
- 电荷中心：配体上的电荷中心是指配体上的非带电基团
- Sample法，是指使用样本距离偏最小二乘法(SAMPLS)来确定留一法的交叉验证r2 。
- 地西泮4、5位开环，影响药物的生物利用度。
- 计算机辅助药物设计的一般原理是, 首先通过X-单晶衍射技等技术获得受体大分子结合部位的结构, 并且采用分子模拟软件分析结合部位的结构性质, 如静电场、疏水场、氢键作用位点分布等信息。
- 用来建立药效团模型的分子需要和受体之间具有相似的作用机制，这样才能保证所有分子具有相似的药效模式。
- 如果未知蛋白质是现在还没有出现过的结构类型，就不能用反向折叠法。
- 测试集是除去训练集以外的，同样具有一定数量、结构特征以及活性范围分布的化合物，用于验证药效团模型的合理性。
- 多序列比对问题其实是双序列比对问题的推广。
- 现代药物发现也有其局限性，其研究对象为“药物-疾病”关系而非“靶点-药物”关系。
- 三级结构的保守性远远大于一级结构的保守性。
- 同源模建第三步到第五步为序列比对、loop区和氨基酸侧链。
- 属于同一个蛋白家族的所有蛋白，存在三维结构基本一样的区域。
- 在标准的流程中，测试集的误差评价结果是偏保守的，因为模型的实际误差要比报告的误差低一些。
- 在得到每个小分子的多构象以后，就需要对这些构象进行叠合以找到共同的药效团模型。
- 与其余药效特征不同，排斥体积并不是对应于配体上特殊的原子或者基团，而是基于配体分子的空间特征。
- CoMSIA方法的假定与CoMFA方法相似，即配基与受体间的共价相互作用是由分子场决定的。
- 体内能与受体特异性结合的物质，称为配体或配基
- 基于片段装配法(fragment-based assembly)会去搜寻已知结构蛋白中与目标蛋白相似的那部分。
- 拟合相关系数中，有三个参数相关系数R、标准偏差S和F检验值。R，F越大，s越小，表明模型的拟合能力越弱。
- 在搭建目标蛋白模型之前，首先需找出与目标蛋白序列同源且已知晶体结构的模板蛋白。
- SYBYL软件中哪个模块可用于构建药效团模型
- 药效团构建中叠合方法主要有：
- 对接过程的常用方法包括
- 下列有关虚拟筛选的描述是正确的有
- 计算机辅助药物设计的作用
- 受体都有其内源性配体，如
- 代表性对接软件
- 药物和受体间属于电性结合的形式有
- 蛋白与小分子的相互作用之一的静电作用包括
- 下列属于同源模建模型评价方法的有
- 以下哪些属于化学结构式编辑程序
- 如何评价对接分子之间的结合强度
- 分子对接的重要原则
- 以下哪些属于蛋白质结构查看软件
- 下面属于药效团模型中负电荷中心的是
- 以下哪些软件可用于构建药效团模型
- 目前计算机辅助药物设计存在的问题
- QSAR模型的内部验证拟和相关系数包括
- 常用序列比对程序通常给出一些统计值，用来表示结果的可信度。BLAST程序中使用的是
- 在药物和受体之间的识别中起重要作用的非键相互作用的主要有：
- 分子对接分类中一般用于精确考虑分子间的识别情况的是
- 在配体和受体相互作用时，在配体的某些取代位置上存在某些原子或原子团可能会和受体产生不利的原子碰撞，这些位置上的原子或原子团占有的位置就构成
- 主要同源建模方法包括刚体装配法和
- 氢键给体：氢键给体主要包括氢原子以及与之相连的氧原子和氮原子，以下属于氢键给体的是
- 蛋白质-配体相互作用的效果可以在一定程度上由（）表示
- （）是把结构未知的蛋白质序列与已知的结构进行匹配，找出一种或几种匹配结构好的结构作为结构未知的蛋白质的预测结构。
- 在得到初步的药效团模型后，对于这个初步模型，还需要依据受体-配体复合物的结构，分析配体-受体相互作用关键位点，对药效团模型进行
- 分子对接最初思想起源于FisherE.的
- 基于知识的蛋白质的建模的方法包括（）和基于片段装配法，主要应用于loop及氨基酸侧链的建模。
- 评价药效团模型的好坏有不同的方法，以下药效团模型的评价参数中正确的是：
- 从头预测法的细分不包括以下哪种
- 药效团的构建是基于训练集实施的，以下属于药效团的构建的方法的是
- 电荷中心可以分为两类：正电荷中心和负电荷中心，下列属于正电荷中心的是：
- 在基于配体的药效团模型构建中，第二步就是
- .以下哪一个药物不属于非甾体类抗炎药物。
- 序列比对是为确定两个或多个序列之间的（），而将它们按照一定的规律排列。
- 同源模建是指如果发现一个序列与另一个三维结构已知的序列具有（），那么，就可以选择基于已知的蛋白用建模方法来预测该未知蛋白质的三维结构。
- 药效团模型中，不同颜色的球代表不同的药效特征元素，其中疏水中心的颜色是
- 在基于配体的药效团模型中，从一系列小分子出发，构建基于配体结构共同特征的药效团，其中第一步是
- 如果没有蛋白质的晶体结构，需要同源模建，可以使用
- QSAR拟合相关系数中，有三个参数相关系数R、标准偏差S和F检验值。下列哪项正确
- 基于受体结构的药效团主要在(配体-受体复合物的晶体结构已经清楚地)条件下使用
- 柔性对接的方法
- 同源模建其实属于蛋白质结构预测技术的其中一个方法，另外还有从头预测法和（ ）。
- 蛋白质需要正确折叠为特定构型，才能发挥其正常功能。
- SAMPLE法确定留一法的交叉验证r2是依据样本距离偏最小二乘法 。
- 刚性的分子对接方法
- 结构优化是为了确定分子低能构象、就需求解与其相对应的分子势能面上的极大值，这一过程称为能量优化。
- 序列比对的结果可以作为两者之间一定存在同源关系的依据
- sp2 或sp3 杂化的氧原子都属于氢键受体。
- 对接方法尚需解决的问题
- 药物与受体的结合强度取决于结合的自由能变化
- 分子对接分类中适合考察比较大的体系是
- 一个蛋白质的结构是由其_____唯一决定的，通过已知一级结构，理论上足以获取二级和三级结构。
- 分子对接方式中，不用考虑分子结构特性的是
- 下列哪些是定量构效关系CoMFA方法用到的参数
- 建立QSAR模型，最常用的就是
- 药效团模型可以通过什么方法来模拟配体分子的活性构象，并据此来推断和解释受体与配体分子之间可能的作用模式。
- 分子场分析法假定配基与受体的结合是共价的，两者的亲和力或配基的生物活性与配基分子周围的空间立体场或静电场有关。
- 地西泮何处的水解开环是可逆的
- 药物作用的特异性，取决于药物分子也就是配体, 与其受体结合的专一性
- 药物作用的靶点包括
- 现代药物发现策略也面临诸多挑战，如所选“靶点”的成药性问题及可能发生的“脱靶效应”。
- 能够与药物结合产生相互作用，发动细胞反应的大分子或大分子复合物的物质称为受体
- 受体具有哪些特征
- 阿司匹林解热作用机制是
- 地西泮具有以下哪类结构母核
- 计算机辅助药物设计是应用量子力学、分子动力学、构效关系等基础理论数据研究药物对酶、受体等作用的药效模型, 从而达到药物设计之目的
- 先导化合物是通过各种途径、方法、手段获得的具有某种药理学或生物学活性的化合物。其不一定为实用的优良药物,可能因其药效不强、特异性不高、毒性较大等而不能直接药用,需要进行结构修饰和改造,使之成为实用的高效、低毒、可控的优良药物,这一过程称为先导化合物的优化.
- 目前已经可以纯粹依靠计算机设计出一个分子即成为新药。
- 计算机辅助药物设计的应用可以加快靶点发现的速度,
- 电影《我不是药神》中的神药“格列宁”是用于治疗
答案:错
答案:对
答案:对
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