中南大学
- 局部比对是寻找两条序列（子序列）最佳匹配区域 （ ）
- 可以利用Entrez条件限定BLAST检索。（ ）
- 最经典的Coiled-Coi模型是以7个氨基酸为重复基序的形式构成。（ ）
- “系统生物学”是以在系统水平上理解生物学，产生了整体大于各部分之和的效果。（ ）
- Full方式是UCSC基因组浏览器最佳的轨道展示模式。（ ）
- 从1993年开始，《Nucleic Acids Research》（《核酸研究》）每年出版专门一期“生物学数据库”，报道生命科学领域最新开发的生物学数据库以及一些重要数据库的更新情况。（ ）
- BLAST采用Smith-Waterman算法进行数据库搜索。（ ）
- GenBank的GBFF格式与Uniprot的GFF格式是一致的。 （ ）
- NCBI的Genome Data Viewer其前身是Map Viewer基因组浏览器。（ ）
- 1952年，Sanger根据胰岛素蛋白质的测序结果，推断蛋白质是排列完美的分子。这是最早的信息论观点。（ ）
- 两序列比对用于 （ ）
- 20世纪八十年代开发的算法有（ ）
- 蛋白质模体数据库有（ ）
- 蛋白质三级结构预测的主要方法包括（ ）。
- BLAST搜索结果过少，怎么办？（ ）
- 生物信息学的应用非常广泛，涉及（ ）
- DeepTMHMM可以预测（ ）。
- 两条DNA序列比对适用条件是 （ ）
- 对BLAST搜索结果进一步筛选可采用（ ）
- ENA提供了哪些检索方法。（ ）
- Needleman & Wunsch算法的特点是 （ ）
- Margaret Dayhoff作出了哪些杰出生物信息学贡献（ ）
- 分子量和等电点预测工具有（ ）。
- Compute pI/Mw 可以预测（ ）。
- NIH将生物信息学定义为 （ ）
- UCSC基因组浏览器中，对轨道进行配置管理选择（ ）
- 以下哪一个数据库可以用来获取有关人类疾病的遗传信息 （ ）
- 预测蛋白质的亚细胞定位位点的工具是（ ）。
- PDB格式的文件是PDB数据库以（ ）的方式存放结构数据的分子量和等电点。
- 密码子使用偏好是指（ ）。
- 关于基因的描述正确的是（ ）。
- 6个开放阅读框通常只有（ ）种是真正能编码蛋白质的序列。
- 基于从头预测的蛋白质三级结构预测程序有（ ）。
- 当BLAST搜索的E值减少时 （ ）
- 与PAM打分矩阵相比，BLOSUM打分矩阵的最大区别是（ ）
- RefSeq与GenBank的区别是 （ ）
- 根据PAM打分矩阵，下列哪个氨基酸最不容易突变？（ ）
- BLAST网络版的优点是（ ）
- 基于单个氨基酸残基统计的经验预测方法是（ ）。
- 有一条蛋白质序列，如果想知道非冗余的核酸序列数据库（nr/nt）是否有该蛋白质序列相近的核酸序列，你将选择哪一个程序？（ ）
- 将下面哪个BLAST参数改变会得到更少的搜索结果？（ ）
- 20世纪七十年代开发的算法有（ ）
- 下列哪个句子最好地两序列全局比对与局部比对的不同？（ ）
A:错 B:对
答案:B:对
A:错 B:对
答案:B:对
A:错 B:对
答案:对
A:错 B:对
答案:对
A:对 B:错
答案:错
A:对 B:错
答案:A:对
A:对 B:错
答案:错
A:对 B:错
答案:错
A:对 B:错
答案:A:对
A:对 B:错
A:确定两个核酸/蛋白质序列在序列水平的结构或功能相关性 B:确定两个核酸/蛋白质序列共享的模体（motifs） C:确定两个核酸/蛋白质序列共享的结构域（domains） D:寻找物种内或物种间基因组（genomes）序列的相关性
A:Pearson和Lupman发表了FASTA算法 B:Needleman-Wunsch提出的全局比对算法 C:Smith-Waterman提出的局部比对算法 D:Da-Fei Feng和Russell F Doolitle开发多序列比对（MSA）算法
A:CDD B:Pfam C:motif D:PRINT
A:同源建模法 B:一致性方法 C:从头预测法 D:折叠识别法
A:不限定生物体 B:多个数据库搜索 C:提高E值 D:尝试更高的PAM矩阵或更低的BLOSUM矩阵
A:同源建模 B:全基因组分析 C:生物信息的收集、组织和存储 D:系统生物学 E:生物序列分析
A:FASTA格式DNA序列 B:β桶跨膜结构 C:α螺旋跨膜结构 D:FASTA格式蛋白质序列
A:确定两个核酸/蛋白质序列在序列水平的结构或功能相关性 B:研究DNA的单核苷酸多态性 C:证实数据库中已知的DNA序列 D:研究DNA非编码区
A:查询覆盖范围 B:相同率 C:物种 D:E值
A:检索交叉参考信息 B:自由文本检索 C:序列相似性搜索 D:高级检索 E:浏览序列版本 F:EBI检索
A:保证找到最佳比对 B:比对的每一步都通过逐步延长子路径得到的 C:是一种全局比对算法 D:保证搜索所有可能的比对
A:开发了第一个生物信息学软件：COMPORTEIN B:编写了《蛋白质序列和结构图册》 C:开发了点突变(PAM)矩阵 D:开发了一套单字母氨基酸代码
A:Paircoil B:TMHMM C:ProtParam D:Compute pI/Mw
A:同位素肽段质量 B:理论同位素肽段质量 C:单一同位素肽段质量 D:平均同位素肽段质量
A:一门学科，包含基因组信息的获取、处理、存储、分配、分析和解释的所有方面。 B:遗传数据的收集、分析以及分发给研究机构的一门新兴学科。 C:数据分析和理论方法、数学建模和计算模拟技术的开发及其在生物、行为和社会系统研究中的应用。 D:计算工具和方法的研究、开发和应用，以扩大生物、医学、行为或健康数据的使用，包括这些数据收集、储存、整理、归档、分析或者可视化。
A:Show transcript table B:Configure this page C:Location D:Chromosome summary
A:OMIM B:GenBank C:dbSNP D:PDB
A:ProtParam B:ProtScale C:PSORT D:PairCoil
A:FASTA格式 B:图片格式 C:压缩文件 D:文本文件
A:编码氨基酸的同义密码子的使用频率相等 B:编码同一种氨基酸的多个同义密码子的使用频率不相等 C:编码氨基酸的同义密码子的使用频率不相等 D:编码同一种氨基酸的多个同义密码子的使用频率相等
A:真核生物的基因结构比较简单且无内含子 B:核苷酸的随机排列 C:真核生物的编码基因区域仅占整个基因组的97%~99% D:遗传物质的最小功能单位
A:1 B:4 C:2 D:3
A:EsyPred3D B:PHYRE2 C:SWISS-MODEL D:Robetta
A:得分值（Score）变大 B:p值变大 C:搜索结果越多 D:K值也减少
A:它是基于远相关蛋白的局部多序列比对 B:它结合了局部和全局比对的信息 C:它最好用于比对相关性较近的蛋白质 D:它是基于近相关蛋白的全局多序列比对
A:RefSeq收录了许多独立的实验室和测序项目提交的公开的DNA序列 B:GenBank提供了非冗余的序列信息 C:RefSeq来源于GenBank，但提供了非冗余的序列信息 D:GenBank序列来源于RefSeq
A:甲硫氨酸 B:半胱氨酸 C:谷氨酰胺 D:丙氨酸
A:可以搜索自建的数据库 B:直观、方便、操作简单灵活、数据库分区、同步更新 C:可以批量分析数据， D:需要消耗本地机的计算资源
A:Chou-Fasman方法 B:GOR方法 C:NNSSP D:Zpred方法
A:blastp B:tblastn C:blastx D:blastn
A:关闭低复杂过滤 B:提高阈值 C:将E值从1变为10， D:将打分矩阵从PAM30改为PAM70
A:Needleman和Wunsch提出的全局比对算法 B:Pearson和Lupman发表了FASTA算法 C:Da-Fei Feng和Russell F Doolitle开发多序列比对（MSA）算法 D:Smith和Waterman提出的局部比对算法
A:全局比对寻找全局最大化，而局部比对寻找局部最大化 B:全局比对允许空位，而局部比对不允许空位 C:全局比对通常用于比对DNA序列，而局部比对通常用于比对蛋白质序列 D:全局比对是比对整条序列，而局部比对是寻找最佳匹配的子序列
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