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生物信息学
- 构建系统发生树,应使用()
- 下列编辑操作表示删除的是( )。
- 下列拉丁文哪个代表人( )。
- 下列哪个是人类基因组组装序列( )
判断基因承受的选择压力时,下面哪种情况表示负选择？
- GenBank中分类码BCT表示是( )。
- mRNA 3′端有( )结构
- 下列编辑操作表示插入的是( )。
- 单核苷酸多态性标记是()。
- Genomics的含义是( )
- EST的含义是()
- 人类基因组计划1990年启动,准备用15年时间投入30亿美元,完成人全部的序列测定,实际上提前了近()年完成?
- Bioinformatics的含义是( )。
- contig的含义是( )。
- 下列编辑操作表示匹配的是()。
下列软件中哪个能进行蛋白质和蛋白质之间的相似性对比？
- 遗传漂变是生物进化的重要作用力,下列哪种情况下最容易发生遗传漂变?
- GenBank中分类码PLN表示是()
蛋白分子进化速率与其功能的关系下列哪个描述是正确的？
- 下列属于没有同义密码子编码的氨基酸是()
blastn的程序选项中（ ）适于跨物种核酸序列快速比对？
- Codon adaption index的中文意思是( )。
- PHI-BLAST的含义是( )。
下列哪个原则用于确定NJ法的最优树？
- GenBank中分类码GSS表示是()
- 构建contig需要大量DNA,需要通过克隆获得。克隆所用的载体主要是YAC和BAC,BAC是指( )
Blastp默认的打分矩阵是（ ）。
- 没有直接参与完成人类基因组计划的国家是()
现有如下一条蛋白序列,请通过BLAST,对其进行分析,寻找与其相似的蛋白序列:
>Protein Sequence
MVRAPCCEKMGLKKGPWTPEEDQILISYIQSNGHGNWRALPKLAGLLRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGNFTREEEDSIIQLHEMLGNRWSAIAARLPGRTDNEIKNVWHTHLKKRLKNYQPPQSSKRHSKNKDSKAPCTSQIALKSSNNFSNIKEDGPGLGSGPNSPQLSSSEMSTVTADSLAVTMDISNSNDQIDSSENFIPEIDESFWTDGLSTSGGGEELQVQFPFHDMKQENVEKDVGAKLEDDMDFWYSVFIKSGDLLELPEF
参数设置:
· Database: Non-redundantprotein sequences (nr)
· Algorithm: blastp
· Word size: 3
· Matrix: BLOSUM62
· Gap Costs: Existence: 11Extension: 1
其他参数为默认，比对后序列一致性为100%的那条序列来源物种是( )。- 微卫星标记又称简短串联重复,是下列的哪一个( )。
- PIR是()
UCSC中的常用的序列比对工具是( )。
- Needleman-Wunsch序列比对算法哪年出现( )年
- Relative Synonymous Codon Usage的中文意思是( )。
在系统发生树构建过程只能够，自展值大小反映了( )
- base pair的含义是( )
- 根据分子时钟假说,下列叙述正确的是( )
- 在用BLAST程序搜索时,当返回的结果较少,想要增加结果,方法有( )。
- RNA的三级结构元件主要有环-环配对、三链螺旋、螺旋-环和假结。
- 在进行双序列比对时,如果空位罚分较小,有可能序列会被空格打散。
- 生物信息数据库中的核苷酸代码表中尿嘧啶的代码是U。
- 在EBI Search时,布尔逻辑运算符AND、OR和NOT必须要大写。
- 1990年,人类基因组计划正式启动。人类基因组计划的具体任务可以概括为建立四张图谱:分别是遗传图谱、物理图谱、 序列图谱和基因图谱
- 在使用动态规划算法进行序列比对时,比对结果是唯一的。
- 目前由NCBI维护的大型文献资源是 PubMed。
拉丁文Mus musculus 是小鼠。
- 20世纪80年代,生物信息服务机构和数据库陆续建立,包括著名的三大核酸数据,欧洲的EMBL、美国GenBank、日本DDBJ诞生。
- 计算两基因间进化距离时,缺失突变必需考虑进去
GC含量高的DNA比GC含量低的DNA更加稳定。
- 构建系统发生树,外群的作用是确定内群的共同祖先。
- 在进行双序列比对时,如果希望序列中不出现空格,可以减小空位罚分。
一般信号肽中包含至少一个带正电荷的氨基酸和一个高度疏水区以通过细胞膜。
- 生物信息数据库中的核苷酸代码表中鸟嘌呤的代码是G。
- 生物信息数据库中的核苷酸代码表中T或C的代码是R。
TAC是一条序列AGTACA的子序列。
- 在GBFF格式中,特性位置145^177 表示从145到177碱基之间序列。
- 生物信息数据库中的核苷酸代码表中非T的代码是X。
- 根据观察到的两序列间的核苷酸差异计算的基因进化距离通常比实际进化距离远?
- RSCU值>1:该密码子使用相对较少
- 美国国家生物技术信息中心的英文缩写是NCBI。
A:FTP B:FASTA C:BLAST D:UPGMA
答案:Mega
A:Insert B:Delete C:Replace D:Match
AI参考:正确答案是B: Delete。Delete表示删除。Insert表示插入，Replace表示替换，Match表示匹配。'
A:Homo sapiens B:Sus scrofa C:Mus musculus D:Xenopus laevis
答案:Homo sapiens
A:mm10 B:Bostau7 C:GRCm39 D:hg38
答案:hg38
A:ω>1 B:ω=1 C:ω=0 D:ω<1
答案:ω<1
A:细菌序列 B:灵长类动物序列 C:啮齿类序列 D:哺乳类序列
答案:细菌序列
A:多聚胞嘧啶 B:帽子和尾巴 C:帽子 D:polyA尾巴
AI参考:正确答案是B:帽子和尾巴。mRNA的3′端具有特殊的结构，即“帽子”（m7GpppNp）和“尾巴”（polyA尾）。帽子结构是一种甲基鸟嘌呤-三磷酸核苷（m7GpppNp）的帽子结构，它能够保护mRNA免受核酸酶的攻击，并促进翻译过程。而尾巴结构则是由腺苷酸（A）聚合而成的，它有助于mRNA在细胞内的定位和稳定性。因此，选项B“帽子和尾巴”是正确的答案。"
A:Delete B:Match C:Replace D:Insert
AI参考:正确选项是【D:Insert】。Insert表示插入，是编辑操作中表示插入的选项。其他选项A、B、C分别表示删除、匹配和替换，不是表示插入的选项。'
A:RFLP B:SSR C:SNP D:RAPD
A:表观遗传学 B:生物信息学 C:蛋白质组学 D:基因组学
A:表达序列标签 B:高通量基因组序列 C:人工合成序列 D:序列标签位点
A:4 B:1 C:3 D:2
A:蛋白质组学 B:生物信息学 C:基因组学 D:表观遗传学
A:碱基对 B:基序 C:重叠群 D:结构域
A:Insert B:Match C:Delete D:Replace
A:Tblstn B:Blastx C:Blastp D:Blastn
A:一个大的开放生物群体中 B:一个小的开放生物群体中 C:一个大的封闭生物群体中 D:一个小的封闭生物群体中
A:噬菌体序列 B:哺乳类序列 C:细菌序列 D:植物、真菌和藻类序列
AI参考:正确答案是D：植物、真菌和藻类序列。GenBank是国际上通用的一种核酸序列数据库，其中的分类码PLN表示植物、真菌和藻类序列。A选项噬菌体序列是另一个分类码TC表示的分类类别，B选项哺乳类序列是另一个分类码MT表示的分类类别，C选项细菌序列是另一个分类码NR表示的分类类别。因此，只有D选项植物、真菌和藻类序列与PLN分类码对应。'
A:其余说法都不对 B:蛋白分子进化速率越大的部位其功能影响越大 C:蛋白分子进化速率与其功能无关 D:蛋白分子进化速率越大的部位其功能影响越小
AI参考:正确答案是B：蛋白分子进化速率越大的部位其功能影响越大。蛋白分子进化速率是指分子在特定时间和空间环境下的变异频率，即蛋白质的氨基酸序列的随机改变率。当蛋白分子进化速率大的部位功能改变时，可能会对生物体产生较大的影响，因此选项B描述正确。选项A、C、D都是错误的描述，因为蛋白分子进化速率与其功能是有关系的。因此，本题的正确答案是B。'
A:甲硫氨酸 B:亮氨酸 C:丝氨酸 D:精氨酸
AI参考:正确答案是C：丝氨酸。同义密码子是指编码相同氨基酸的密码子，在密码子列表中可以看出丝氨酸与半胱氨酸的密码子是相同的，因此属于没有同义密码子编码的氨基酸。其他选项中甲硫氨酸、亮氨酸和精氨酸的密码子不相同，因此不属于没有同义密码子编码的氨基酸。'
A:tblastn B:megablast C:blastn D:discontinuous megablast
A:最优密码子 B:有效密码子数 C:密码子偏好性 D:密码子适应指数
A:模式识别迭代 blast B:基本的局部序列比对搜索工具 C:位点特异的迭代blast D:动态规划算法全局比对
A:替代速率最快的树 B:似然率最大的树 C:支长最小的树 D:支长最大的树
AI参考:正确选项是C:支长最小的树。在系统发育学中，NJ法（Neighbor-joining法）是一种用于构建系统发生树的算法，而最优树是指能最好地反映真实系统发育关系的树。在确定最优树时，通常会考虑多个因素，其中支长是最重要的一个因素之一。支长是指各个分支的长度总和，它代表了分支在系统发育关系中的重要性。因此，用于确定NJ法的最优树的规则是选择支长最小的树。其他选项如替代速率最快的树、似然率最大的树、支长最大的树等，虽然可能在某些情况下具有意义，但在确定最优树时并不是最重要的因素。'
A:灵长类动物序列 B:基因组测定序列 C:啮齿类序列 D:无脊椎动物序列
A:酵母人工染色体 B:病毒 C:质粒 D:细菌人工染色体
A:BLOSUM62 B: PAM1 C: PAM70 D:PAM250
AI参考:正确答案是A:BLOSUM62。Blastp是一种用于比较蛋白质序列的生物信息学工具，其默认的打分矩阵是BLOSUM62，该矩阵是基于多种蛋白质序列的同源性和差异性进行构建的。PAM是一种进化打分矩阵，用于衡量序列相似性，而Blastp默认的打分矩阵是BLOSUM62，而不是PAM系列矩阵。因此，选项A是正确答案。'
A:德国 B:俄罗斯 C:英国 D:中国
A:番茄 B:石榴 C:烟草 D:大豆
A:RFLP B:RAPD C:STR D:SNP
A:核酸数据库 B:mRNA数据库 C:蛋白质数据库 D:启动子数据库
A:VisiGene B:Table Browser C:BLAST D:BLAT
AI参考:正确答案是D:BLAT。UCSC是一个生物信息学数据库，其中常用的序列比对工具是BLAT，它是一种快速、高精度的全基因组比对工具，常用于基因组注释和比较基因组学研究。其他选项VisiGene、Table Browser和BLAST虽然也是生物信息学中常用的工具，但它们不是UCSC中的序列比对工具。'
A:1988 B:1970 C:1977 D:1991
A:有效密码子数 B:密码子适应指数 C:密码子使用的相对频率 D:密码子偏好性
A:单系群的可靠性 B:序列间一致性的大小 C:同源性大小 D:物种进化速率的大小
A:结构域 B:跨叠克隆群 C:碱基对 D:基序
A:所有的蛋白质都保持一个相同的恒定的进化率 B:对于每一个给定的蛋白质,分子进化的速率是逐步减慢的,就像一个不准时的时钟一样 C:对于每一个给定的蛋白质,其分子进化速率在所有的进化分支上是大致恒定的 D:所有的蛋白质进化速率都与化石记录相符合
A:进行多个数据库搜索 B:将E值调大 C:尝试更高的PAM矩阵和更低的BLOSUM矩阵 D:将E值调小
A:对 B:错
A:对 B:错
A:对 B:错
A:对 B:错
AI参考:正确答案是B：错。在EBI Search时，布尔逻辑运算符AND、OR和NOT都是小写的。'
A:错 B:对
AI参考:正确答案是B：对。人类基因组计划的具体任务可以概括为建立四张图谱，分别是遗传图谱、物理图谱、序列图谱和基因图谱。该计划于1990年正式启动，旨在测定组成人类基因组的全部DNA序列，从而绘制人类基因的详细图谱，帮助科学家们了解人类健康的秘密，发现疾病的原因，并开发新的治疗方法。因此，该题描述是正确的。'
A:对 B:错
A:对 B:错
A:对 B:错
AI参考:正确答案是B：错。Mus musculus是拉丁文，意思是“老鼠”，而不是“小鼠”。因此，这个判断题是错误的。'
A:对 B:错
AI参考:答案：A。\r推理过程：本题考查生物信息学的相关知识，是正确的。所以选择A。'
A:对 B:错
A:对 B:错
A:对 B:错
A:错 B:对
A:错 B:对
A:错 B:对
A:对 B:错
A:对 B:错
A:错 B:对
A:错 B:对
A:对 B:错
AI参考:B:错。根据核苷酸差异计算的基因进化距离通常接近实际进化距离，但可能会受到一些因素的影响，如序列组装质量、突变率等。因此，在实际应用中，通常需要进行更深入的分析和比较，以获得更准确的基因进化距离。'
A:错 B:对
AI参考:正确答案是B：对。RSCU值是衡量一个密码子使用频率的一个指标，它等于所有可能的编码三联体密码子中有多少种能编码出该氨基酸，如果RSCU值大于1，说明该密码子使用相对较多；如果RSCU值小于1，说明该密码子使用相对较少。因此，题目中的说法是正确的。'
A:错 B:对
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