生物信息学期末考试答案2023春

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生物信息学

1. 基因组序列拼接的主要方法不包括（ ）

A:利用BAC文库信息 B:基于OLC的方法 C:利用序列相似性 D:利用物理图谱
AI参考:正确选项是【基于OLC的方法】。基因组序列拼接的主要方法包括利用BAC文库信息、利用物理图谱和利用序列相似性等，这些方法都是基于基因组测序数据，通过比对、组装和拼接等步骤将测序数据组装成完整的基因组序列。而基于OLC的方法是一种基于重叠群文库的基因组组装方法，不是基因组序列拼接的主要方法。'

2. 如下序列中哪些可以用于构建物理图谱（ ）

A:物种表型 B:SNP C:微卫星 D:遗传表型标记
AI参考:正确答案是C：微卫星。微卫星是一种能够用于构建物理图谱的标记类型，它具有高度多态性，能够提供大量的遗传信息，因此可以用于构建物理图谱。物种表型、SNP和遗传表型标记虽然也是重要的遗传标记类型，但它们对于构建物理图谱的帮助有限。因此，选项C是正确答案。'

3. 常用的中文文献数据库不包括（ ）。

A:万方 B:维普 C:知网 D:Web of Science
答案:百度文库

4. 下列哪个是果蝇基因组数据库（ ）

A:GenBank B:Uniprot C:EMBL D:FLyBase
AI参考:正确答案是A:GenBank。GenBank是全球最大的生物信息数据库，包含了大量的生物基因组数据，包括果蝇基因组数据。其他选项Uniprot、EMBL和FlyBase都不是专门针对果蝇基因组的数据库。因此，答案为A。'

5. 蛋白质同源建模要求序列一致性超过( )

A:30% B:60% C:50% D:40%
答案:30%

6. OMM是（ ）

A:国家核酸数据库 B:水稻基因组计划 C:人类基因组计划 D:在线人类孟德尔遗传数据库
AI参考:正确答案是C：人类基因组计划。OMM是关于人类基因组的数据库，因此答案为C，即人类基因组计划。其他选项A、B、D与OMM无关。'

7. 隐马尔可夫模型是哪个英文单词（ ）

A:CDD B:HMM C:GSS D:HTGS
AI参考:正确答案是B:HMM，即隐马尔可夫模型的英文缩写。隐马尔可夫模型（Hidden Markov Model，HMM）是一种统计模型，用于描述随机过程，该过程在观察和隐藏两个状态下进行。它通过概率分布描述状态转移和观测值生成，并能够用于语音识别、手写识别等领域。因此，正确答案为B选项。'

8. 基于序列重叠(overlap)一致性进行基因组测序拼接软件是（ ）

A:ABySS B:Velvet C:SOAPdenove D:Phre/Phrap
AI参考:基于序列重叠(overlap)一致性进行基因组测序拼接软件是C:SOAPdenove。SOAPdenove是一款基于序列重叠(overlap)一致性进行基因组测序拼接的软件，它能够处理长读长数据，并且具有较高的拼接效率和准确性。其他选项中，ABySS和Velvet是用于组装低覆盖度数据的软件，Phrap是一款常用的Sanger测序拼接软件，而Phred/Phrap是一个全面的生物信息学工具集，不只针对基因组测序拼接。因此，答案为C。'

9. 文献信息数据库不包括（ ）

A:PubMed B:Web of Science C:百度文库 D:知网
答案:数据

10. 下列属于代谢数据库的是（ ）

A:TRANSFAC B:TRRD数据库 C:KEGG D:DIP 相互作用蛋白质数据库
AI参考:正确选项是 C:KEGG。KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是一个生物代谢、通路和调控的数据库系统，它提供了大量的生物分子（如蛋白质、核酸、糖类、脂质等）的信息，包括其在细胞中的代谢途径、基因调控网络等。因此，KEGG数据库属于代谢数据库。而其他选项 A、B 和 D 虽然也提供了有关生物分子和代谢途径的信息，但它们并不是专门针对代谢的数据库。'

11. 二代测序技术不包括（ ）

A:桑格尔荧光测序法 B:ABI公司SOLiD测序技术 C:Illumina的Solexa边合成边测序 D:Roche 454焦磷酸测序技术
答案:Sanger测序法AI参考:正确答案是A：桑格尔荧光测序法。二代测序技术主要包括ABI公司SOLiD测序技术、Illumina的Solexa边合成边测序和Roche 454焦磷酸测序技术，不包括桑格尔荧光测序法。因为该选项在问题中未被提及，所以答案是A。'

12. 下列哪个是一代测序仪包括（ ）

A:Roche公司454测序仪 B:ABI3730XL荧光自动测序仪 C:Illumina公司Solexa基因组分析仪 D:ABI公司的SOLiD测序仪
AI参考:正确答案是C：Illumina公司Solexa基因组分析仪。这是一道关于测序仪的常识题。一代测序仪包括Illumina公司的Solexa基因组分析仪，Roche公司的454测序仪，ABI公司的SOLiD测序仪，ABI3730XL荧光自动测序仪是二代测序仪的一种。所以选项C正确。'

13. 能够进行蛋白质结构测定是（ ）

A:X射线晶体衍射法 B:蛋白质谱技术 C:免疫共沉淀技术 D:酵母双杂交系统
AI参考:正确答案是A：X射线晶体衍射法。X射线晶体衍射法是一种常用的蛋白质结构测定方法，可以获得蛋白质分子的三维结构信息。其他选项B、C、D虽然也都是蛋白质研究的重要技术手段，但无法直接用于蛋白质结构的测定。因此，A选项是正确答案。'

14. 关于Linux操作系统，下列说法不正确的是（ ）

A:运行稳定 B:操作极其简单 C:自由免费 D:运算能力强大
答案:Linux操作系统不是UNIX系统的变种，因此Linux上程序不适合UNIX平台上运行AI参考:关于Linux操作系统，说法不正确的是B:操作极其简单。Linux操作系统是一个功能强大、稳定可靠、安全、免费、多用户支持、性能强大、支持多种硬件设备等优点的操作系统。它的命令行操作相对复杂，需要一定的学习成本。因此，选项B“操作极其简单”是不正确的。其他选项A（运行稳定）、C（自由免费）、D（运算能力强大）都是Linux操作系统的优点。'

15. 不属于遗传学中心法则的信息传递方向是（ ）

A:DNA-＞RNA B:RNA -＞ Protein C:DNA -＞ DNA D:Protein -＞ Protein
答案:描述从一个基因到相应蛋白质的信息流的途径.遗传信息贮存在DNA中,DNA被复制传给子代细胞,信息被拷贝或由DNA转录成RNA,然后RNA翻译成多肽.不过,由于逆转录酶的反应,也可以以RNA为模板合成DNA.AI参考:正确答案是D：Protein -＞ Protein。遗传学中心法则的信息传递方向包括DNA到RNA、RNA到蛋白质、DNA到DNA，因此选项A和B都是正确的传递方向，选项C也是正确的传递方向，因为它是DNA复制的过程。而蛋白质到蛋白质不属于中心法则的信息传递方向，因此选项D是正确答案。'

16. fastq数据中每一条记录有多少行？（ ）

A:2 B:1 C:4 D:3
AI参考:正确选项是D：3。FASTQ文件格式是一种用于存储DNA序列数据和与其相关的质量值的文件格式。在FASTQ文件中，每一条记录通常包含三条信息：一条序列、序列的注释和与其相关的质量值。因此，每一条记录有三行，所以正确答案是D：3。'

17. 以下不是常见数据库文件格式的是（ ）

A:FASTA格式 B:GenBank flatfile格式 C:Word文档格式 D:GCG格式
答案:accdb文件AI参考:正确选项是【C:Word文档格式】。Word文档格式不是常见数据库文件格式，而其他选项都是常见数据库文件格式。A选项的FASTA格式是核酸序列文件格式之一，常用于基因组数据存储；B选项的GenBank flatfile格式是生物信息学中常用的数据库文件格式之一，用于存储和交换生物信息学数据；D选项的GCG格式是一种用于存储植物基因组数据的文件格式。'

18. 长度为N的序列，所有可能的长度为K的子序列数量为( )。

A:N+1 B:N-K+1 C:N-K D:N
答案:对

19. 人类基因组计划没有完成的是什么图谱（ ）

A:序列图谱 B:遗传图谱 C:生物图谱 D:物理图谱
答案:遗传图谱;物理图谱;基因图谱;序列图谱AI参考:人类基因组计划没有完成的图谱是生物图谱。人类基因组计划旨在绘制人类基因组的序列图谱，这是对人类基因组进行精细分析的基础。遗传图谱、物理图谱和序列图谱是完成人类基因组计划的三个重要步骤。而生物图谱不属于人类基因组计划的范畴。因此，答案为C：生物图谱。'

20. 序列比对算法不包括（ ）。

A:冒泡排序法 B:点阵法 C:动态规划算法（the dynamic programming method） D:词或者K串法(BLAST)
答案:blast

21. 等电聚焦电泳利用了氨基酸是两性分子。（ ）

A:对 B:错
答案:各有特定的等电点AI参考:答案是A：对。等电聚焦电泳是一种电泳技术，用于分离不同等电点的蛋白质或氨基酸。氨基酸是两性分子，具有亲水性和亲脂性，因此可以通过调节pH值和电场强度来控制氨基酸的迁移和分离。等电聚焦电泳利用了氨基酸的这一特性，通过聚焦在不同pH值的区域来实现分离。因此，答案是A，即等电聚焦电泳利用了氨基酸是两性分子。'

22. 遗传密码子一共63个，其中有3个不编码氨基酸，为终止密码子。（ ）

A:错 B:对
AI参考:答案：B:对。遗传密码子是信使RNA分子中每相邻的三个核苷酸编成一组，在蛋白质合成时，不仅用来决定氨基酸的排列顺序，而且还兼有调控肽链长度及氨基酸结合于肽链上的功能。密码子共64个，其中有3个为终止密码子不编码氨基酸。因此本题表述正确。'

23. E值是序列比对后衡量序列相似性的期望值。（ ）

A:对 B:错
AI参考:答案是B：错。E值是序列比对中的一个参数，用于衡量序列相似性的期望值，但它不是序列比对的唯一参数。在序列比对过程中，还有其他因素需要考虑，如序列长度、互补链、链方向等。因此，仅仅根据E值来衡量序列相似性是不准确的。'

24. 同源的序列有一定的相似性。（ ）

A:错 B:对
AI参考:答案是B：对。同源序列是指具有相同或相似功能的基因或蛋白质的序列，它们在进化上具有共同的起源，因此具有一定的相似性。'

25. 进化树构建可以使用Bootstrap进行统计检验。（ ）

A:对 B:错
答案:错AI参考:答案是A：对。进化树构建可以使用Bootstrap方法进行统计检验，以确定构建的进化树是否具有可靠的可靠性。因此，该判断题是正确的。'

26. 蛋白质结构改变可能会不影响蛋白功能。（ ）

A:对 B:错
答案:正确AI参考:蛋白质结构改变可能会影响蛋白功能。蛋白质的结构和功能是相互关联的，蛋白质的结构变化可能会影响到其功能，即使是微小的变化也可能会产生影响。因此，这个判断题的正确答案是B：错。'

27. 进化树上的任何一个分支点可以分成两个，也可以分支三个以上。（ ）

A:错 B:对
AI参考:正确答案是B：对。进化树上的分支点可以分成两个，也可以分支三个以上，这句话是正确的。进化树是一种用于表示生物进化关系和进化路径的树状图，分支点是进化树上的节点，可以表示不同物种之间的进化关系。因此，这句话描述了进化树的基本特征，是正确的。'

28. 人类基因组一共有23对染色体。（ ）

A:对 B:错
AI参考:答案是B：错。人类基因组一共有24对染色体。'

29. 基因芯片可以检测同一基因的不同转录本。（ ）

A:错 B:对
AI参考:答案是B：对。基因芯片可以检测同一基因的不同转录本。基因芯片是一种用于基因检测的技术，它能够同时检测多个样品的基因表达情况，包括同一基因的不同转录本。通过将不同转录本的探针固定在芯片上，可以比较不同样品中同一基因的不同转录本的表达水平，从而实现对基因表达的定量分析。因此，基因芯片可以检测同一基因的不同转录本。'

30. 核酸才是生物体内的遗传物质。（ ）

A:错 B:对
答案:DNA

31. 美国遗传学家____以果蝇为实验材料，创立了____。


AI参考:正确选项为：美国遗传学家摩尔根以果蝇为实验材料，创立了基因连锁交换遗传学说。'

32. 任意一段DNA序列，可能存在____种不同的开放阅读框。


AI参考:正确选项为：无数。DNA序列中可能存在无数种不同的开放阅读框，因为一个开放阅读框通常是指一段具有特定开放阅读起始位点和终止位点的DNA序列，可以编码特定的蛋白质或RNA分子。因此，如果有一段DNA序列，那么它可能存在无数个不同的开放阅读框，取决于其内部结构和基因表达调控等因素。'

33. 基因组测序的基本策略有：____和____。


答案:对AI参考:正确选项为：目标区域策略和全基因组扫描策略。基因组测序的基本策略包括目标区域策略和全基因组扫描策略。目标区域策略是针对特定的基因或调控区域进行测序，而全基因组扫描策略则是通过全基因组范围的序列测定来发现变异。这两种策略各有优缺点，可根据具体情况选择使用。'

34. PCR实验时需要自己设计一对____。


AI参考:正确选项应为：PCR实验时需要自己设计一对引物（primer）。引物是PCR实验中非常重要的一个部分，用于与目标DNA序列互补配对，从而引发DNA的合成。因此，在PCR实验中，需要自己设计一对引物。'

35. ____(Bootstrap)是放回式抽样统计方法。通过对数据进行多次重复取样，构建多个进化树。从而检验给定树的分支可信度。


AI参考:正确选项是（Bootstrap）是放回式抽样统计方法，通过多次重复取样构建多个进化树来检验给定树的分支可信度。这个答案描述的是Bootstrap方法，它是一种用于评估生物信息学中进化树可靠性的统计方法。这种方法通过从原始数据集中多次重复抽样，构建多个进化树，并从这些树中估计每个分支的可靠程度。这种方法是一种放回式抽样统计方法。'

36. 维系蛋白质分子空间结构的作用力包括：____、____、____和____。


AI参考:正确选项是：二硫键、疏水相互作用、氢键、盐键（或离子键）。维系蛋白质分子空间结构的作用力包括二硫键、疏水相互作用、氢键和盐键（或离子键）。其中，二硫键和盐键属于离子键的一种，是维持蛋白质空间结构的重要作用力；疏水相互作用是蛋白质分子内部和分子间相互作用的一种形式，也是维持蛋白质空间结构的重要因素；氢键是蛋白质分子间相互作用的一种重要形式，可以影响蛋白质的空间结构和活性。因此，以上四种作用力共同维系着蛋白质分子的空间结构。'

37. 1970年Needleman和Wunsch提出了著名的____，是生物信息学的重要贡献。


答案:对AI参考:正确选项是：Needleman-Wunsch算法，这是一种用于比较两个序列之间的相似性的算法，由David Needleman和Bill Wunsch于1970年提出，是生物信息学的重要贡献。'

38. 英国博物学家达尔文于____年发表了____一书。


AI参考:英国博物学家达尔文于1859年发表了《物种起源》一书。'

39. 同源结构建模预测工具网站工具是：____


AI参考:正确选项是：Python。Python是一种广泛使用的编程语言，具有强大的数据处理和可视化功能，适合用于同源结构建模预测工具网站工具。Python的语法简洁易读，易于学习，并且拥有丰富的第三方库，可以方便地进行数据处理、数据挖掘、机器学习等方面的开发。因此，Python是同源结构建模预测工具网站工具的常见选择。'

40. 数据库常用的检索工具有：____和____。


答案:分类途径;题名途径;代码途径;著者途径;主题途径AI参考:正确答案是“搜索引擎”和“数据库管理系统”。数据库常用的检索工具有搜索引擎和数据库管理系统。搜索引擎可以帮助用户快速地找到相关信息，而数据库管理系统则可以对数据库中的数据进行管理和查询。这两种工具在数据库检索中都是常用的工具。'

41. 生物信息数据库的简要分类？


答案:基因组数据库;核酸和蛋白质序列数据库;生物大分子结构数据库;以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库

42. 人类基因组计划的主要内容是什么？


答案:人类基因组计划(human genome project,HGP)是由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动的.美国.英国.法国.德国.日本和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划.按照这个计划的设想,在2005年,要把人体内约2.5万个基因的密码全部解开,同时绘制出人类基因的谱图.换句话说,就是要揭开组成人体2.5万个基因的30亿个碱基对的秘密.人类基因组计划与曼哈顿原子弹计划和阿波罗计划并称为三大科学计划.被誉为生命科学的“登月计划”.

43. 什么是生物信息学 及其主要研究内容与意义？


答案:(1)认识生物本质了解生物分子信息的组织和结构,破译基因组信息,阐明生物信息之间的关系.(2)改变生物学的研究方式改变传统研究方式,引进现代信息学方法(3)在医学上的重要意义为疾病的诊断和治疗提供依据,为设计新药提供依据AI参考:正确选项为：生物信息学是一门利用数学、计算机科学和生物信息学技术来研究和解析生物数据的新兴学科，其主要研究内容有基因组测序、基因组图谱、转录组测序、蛋白质组学等，研究意义在于加快新药开发、疾病诊断和个性化治疗等。 生物信息学是利用数学、计算机科学和生物信息学技术来研究和解析生物数据的新兴学科。它主要研究生物数据的分析方法和应用，以及这些数据所揭示的生物机制和规律。生物信息学涵盖了广泛的领域，如基因组测序、基因组图谱、转录组测序、蛋白质组学、代谢组学等。通过对这些生物数据的分析，生物信息学家可以揭示生物体的遗传结构和功能，进而研究生物体的进化、发育和疾病等重要问题。 生物信息学的意义在于加快新药开发、疾病诊断和个性化治疗等方面。通过对生物数据的分析，生物信息学家可以预测药物的靶点、作用机制和副作用，从而为药物研发提供重要的指导。同时，生物信息学也可以帮助医生更好地理解疾病的发病机制，进而开发出更有效的治疗方法。此外，生物信息学还可以促进跨学科的合作和交流，推动生物学和其他学科的交叉融合。 总之，生物信息学是一门新兴的跨学科领域，其研究内容和方法正在不断发展和完善。它对于揭示生命奥秘、推动医药卫生事业的发展具有重要的意义。"

44. 系统发生树构建方法？


答案:BLASTAI参考:系统发生树构建方法主要包括以下几种： 1. 直接比较法：通过对现存物种的基因组进行测序和分析，直接比较和比较这些基因组，找出相似性和差异性，从而确定系统发生树中的各个物种的亲缘关系。 2. 间接分析法：通过对现存物种的蛋白质序列进行分析，找出其共同祖先基因中的变异，这些变异可以追溯到共同祖先的基因突变。通过对这些变异的分析，可以构建系统发生树，揭示不同物种之间的亲缘关系。 3. 分子钟假设法：分子钟假设是指生物种群中某些遗传物质的变异率在不同时间段内保持相对稳定，从而使得不同物种之间的遗传距离在时间上保持相对稳定。利用分子钟假设可以推算出不同物种之间的时间关系，从而构建系统发生树。 4. 进化树构建法：通过构建进化树模型，将不同物种的遗传物质数据输入到模型中，利用模型中的算法和参数，对数据进行拟合和优化，从而得到系统发生树。常用的进化树构建方法包括邻接法、最大似然法、最小距离法等。 以上方法各有优缺点，需要根据具体情况选择使用。"