第三章 生物学数据库及其检索:本章包括生物学数据库概述,NCBI数据库与数据资源,UCSC基因组浏览器与数据库资源、EMBL-EBI数据库与数据库资源。3.1生物学数据库概述:这一节主要介绍生物学数据库的类型和查找生物学资源的途径。
3.2NCBI数据库与数据资源:这一节主要介绍NCBI概述和NCBI中重要子库,例如文献数据库PubMed、核酸序列数据库GenBank、参考序列数据库RefSeq、以及gene数据库等。
3.3UCSC基因组浏览器与数据库资源:这一节主要介绍UCSC基因组浏览器与数据资源。主要分三部分内容:UCSC概述、UCSC基因组浏览器、UCSC常用工具。
3.4EMBL-EBI数据库与数据库资源:这一节主要介绍介绍EMBL-EBI数据库与数据库资源。 包括EMBL-EBI概述、EMBL的基因组和核酸数据资源、UniProt蛋白质数据库。
3.1生物学数据库概述:这一节主要介绍生物学数据库的类型和查找生物学资源的途径。
3.2NCBI数据库与数据资源:这一节主要介绍NCBI概述和NCBI中重要子库,例如文献数据库PubMed、核酸序列数据库GenBank、参考序列数据库RefSeq、以及gene数据库等。
3.3UCSC基因组浏览器与数据库资源:这一节主要介绍UCSC基因组浏览器与数据资源。主要分三部分内容:UCSC概述、UCSC基因组浏览器、UCSC常用工具。
3.4EMBL-EBI数据库与数据库资源:这一节主要介绍介绍EMBL-EBI数据库与数据库资源。 包括EMBL-EBI概述、EMBL的基因组和核酸数据资源、UniProt蛋白质数据库。
[单选题]分类码PLN在GenBank中表示的是什么?

选项:[哺乳类序列

, 细菌序列

, 噬菌体序列

, 植物、真菌和藻类序列

]
[单选题]下列选项中哪个是UCSC中的常用的序列比对工具?

选项:[VisiGene

, TableBrowser

, BLAT

, BLAST

]
[单选题]如:我要查找Shi Y在Nature或Science上发表的论文,规范的检索语言是哪一个?

选项:[Shi Y[AU]  AND Nature OR Science[Journal]   



, Shi Y[AU]  AND (Nature OR Science)[Journal]



, Shi Y[AU]   AND (Nature[Journal] OR Science[Journal])



, Shi Y[AU]  AND Nature[Journal] OR Science[Journal]



]
[判断题]在Entrez系统常用检索的方法中,使用的布尔运算符AND、OR和NOT是可以小写的。

选项:[对, 错]
[判断题]ExPASy是一个关于核酸分析的重要门户网站。

选项:[错, 对]
[判断题]在使用EBI search,如果有特殊字符,需要用“/”进行转义后再进行搜索

选项:[错, 对]
[判断题]在GBFF格式中,特性位置146^197  表示从146到197碱基之间的这段序列。

选项:[对, 错]
[判断题]UniProt数据库中的UniProtKB没有注释数据,只含有蛋白质的序列信息。

选项:[错, 对]
[判断题]目前最权威的核酸序列数据库是gene数据库。

选项:[对, 错]
[判断题]使用EBI  Search时可以用正则表达式进行搜索,它以“”作为开头和结尾, [hm] ouse表示第一个字母是h或m,后面必须是ouse。

选项:[对, 错]
[单选题]如:我要查找Shi Y在Nature或Science上发表的论文,规范的检索语言是哪一个?

选项:[Shi Y[AU]  AND Nature[Journal] OR Science[Journal]



, Shi Y[AU]  AND Nature OR Science[Journal]   



, Shi Y[AU]   AND (Nature[Journal] OR Science[Journal])



, Shi Y[AU]  AND (Nature OR Science)[Journal]



]
[单选题]分类码PLN在GenBank中表示的是什么?

选项:[细菌序列

, 噬菌体序列

, 植物、真菌和藻类序列

, 哺乳类序列

]
[单选题]下列选项中哪个是UCSC中的常用的序列比对工具?

选项:[BLAT

, TableBrowser

, BLAST

, VisiGene

]
[判断题]ExPASy是一个关于核酸分析的重要门户网站。

选项:[对, 错]
[判断题]在Entrez系统常用检索的方法中,使用的布尔运算符AND、OR和NOT是可以小写的。

选项:[错, 对]
[判断题]在使用EBI search,如果有特殊字符,需要用“/”进行转义后再进行搜索

选项:[错, 对]
[判断题]使用EBI  Search时可以用正则表达式进行搜索,它以“”作为开头和结尾, [hm] ouse表示第一个字母是h或m,后面必须是ouse。

选项:[对, 错]
[判断题]UniProt数据库中的UniProtKB没有注释数据,只含有蛋白质的序列信息。

选项:[错, 对]
[判断题]在GBFF格式中,特性位置146^197  表示从146到197碱基之间的这段序列。

选项:[对, 错]
[判断题]目前最权威的核酸序列数据库是gene数据库。

选项:[错, 对]

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