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临床研究常用软件介绍与应用
- 哪个临床试验查询和注册网站目前收录了210个国家超过33万个临床试验，全面而且描述详细，撤回和进行不下去的临床试验也能够检索到，还能找到撤回原因（ ）。
- 瀑布图一般使用什么软件作图（ ）。
- 知网等数据库的高级检索功能中所用到的逻辑关系词不包括（ ）。
- 常用于按照相同的时间间隔显示数据的趋势的图表类型为（ ）。
R语言的开发者是
- 分析性研究中，根据时间方向划分，通过暴露因素追踪结局的研究是（ ）。
- 将总体单位按其属性特征分成若干类型或层，然后在类型或层中随机抽取样本单位的抽样方法为（ ）。
- Image pro plus分析免疫荧光图片中的Number Of Bins选项的目的是（ ）。
- 下列哪款软件不是常用的统计软件？（ ）
- ICGC数据库有几种癌症数据？（ ）
- Figure中哪种类型的图被一般杂志要求无论如何放大都不会失真（ ）。
- 为了小鼠皮下肿瘤生长速率的情况，我们可以通过XY线图中的哪种类型图表进行展示？（ ）
- 统计学依据数据的计量尺度将数据划分为三大类，不包括（ ）。
- 在进行单因素方差分析时，需选定置信度即与I型错误发生概率相关的显著性水平α的值，通常可选择（ ）。
- 任何在人体（病人或健康志愿者）进行药物的系统性研究，以证实或揭示试验药物的作用、不良反应及/或试验药物的吸收、分布、代谢和排泄，目的是确定试验药物的疗效与安全性是（ ）。
clusterprofiler包的主要功能为
以下那个数据库为临床数据库
- 为了计算某药物的IC50，我们可以通过XY线图中的哪种类型图表进行展示？（ ）
- GSEA算法所使用的的数据库为？（ ）
HistCite能用来分析哪个数据库所导出的数据？（ ）
- Image J 对Western blot 条带定量分析包括哪些步骤？（ ）
- 文献分析软件包括（ ）。
- XENA的功能包（ ）。
- 以0为中心单峰分布的有（ ）。
以下哪些是评估突变后果的算法
- 单维度分组柱形图可以使用哪些统计学方法？（ ）
- GraphPadPrism主要可用于（ ）。
差异分析的R包包括
- 差异分析的R包包括（ ）。
- Western blot定量分析的意义是（ ）。
- Excel中的方差分析工具提供了3种不同类型，包括（ ）。
- 在目前国际杂志发表的论文中，约80%图片出自哪三个专业图表设计软件？（ ）
- 以下哪些是评估突变后果的算法？（ ）
- Rstudio的界面包括（ ）。
- 本课程主要介绍了哪两种图片处理及分析软件的应用？（ ）
- 药物的IC50计算需要哪几个参数？（ ）
- 在进行患者的基线数据比较时，两组间的比较常用（ ）。
- 用Excel进行做图时，点击选中的图表后，单机菜单栏的“设计”，可进行下列哪些操作？，（ ）
TCGA的分析功能包括
- 图片处理分析主要包括（ ）。
- 图片处理分析是为了从图片中提取相关数据并进行统计分析。（ ）
TGCA数据库包括TARGET数据库
- NHANES旨在收集有关中国家庭人口健康和营养的信息。（ ）
- 免疫荧光染色分析的优势在于能够同时对多个蛋白进行统计分析。（ ）
- GraphPad无法修改生成图表的颜色。（ ）
- 相关性分析不需计算R值和P值。（ ）
R语言中常用pheatmap来进行热图绘制
- 假设检验的结论为：当检验统计量的观察值落入危险域，放弃虚拟假设；反之，则接收。（ ）
- EndNote只能用来插入引文。（ ）
- 在进行某个预测因素的临床诊断价值的准确性分析时，接收者操作特征曲线即ROC曲线则是最常用的一种分析方法。（ ）
A:中国临床试验注册中心 B:美国国家癌症研究所 C:WHO国际临床试验注册平台 D:美国临床试验注册库
AI参考:答案：C：WHO国际临床试验注册平台。WHO国际临床试验注册平台是目前收录了210个国家超过33万个临床试验，全面而且描述详细，撤回和进行不下去的临床试验也能够检索到的临床试验查询和注册网站，能够找到撤回原因。因此，答案为C。'
A:Photoshop B:Image J C:PPT D:Excel
AI参考:正确选项是D:Excel。瀑布图是一种用于展示数据变化的图表类型，通常用于分析数据的增长趋势。Excel软件中自带了瀑布图插件，可以方便地创建和编辑瀑布图。Photoshop是用于图像处理的软件，Image J是用于生物医学图像分析的软件，PPT主要用于制作演示文稿，因此不符合题意。'
A:AND B:NOT C:OR D:BUT
AI参考:正确答案是D:BUT。知网等数据库的高级检索功能中所用到的逻辑关系词包括AND（与）、OR（或）、NOT（非），不包括BUT（但是）。所以选项D是正确答案。'
A:柱形图 B:折线图 C:饼图 D:条形图
AI参考:正确答案是B：折线图。折线图（line chart）常用于按照相同的时间间隔显示数据的趋势，它可以直观地展示数据随时间变化的连续变化情况。柱形图（bar chart）通常用于展示不同类别的数据，条形图（bar graph）通常用于展示不同类别的数据之间的比较。饼图（pie chart）主要用于展示数据中的比例关系，但它不能直观地展示数据随时间变化的趋势。因此，常用于按照相同的时间间隔显示数据的趋势的图表类型是折线图。'
A:John Chambers B:Rick Becker C:Allan Wilks D:Hadley Wickham
答案:Steve JobAI参考:正确选项是【D:Hadley Wickham】。R语言的开发者是英国统计学家Hadley Wickham。他开发了R语言的许多重要包，如ggplot2、dplyr等，为R语言的发展做出了重要贡献。John Chambers是R语言早期的重要开发者之一，但现在已经不是R语言的主要开发者。Rick Becker、Allan Wilks也是R语言的重要开发者，但并非主要开发者。因此，正确答案为D：Hadley Wickham。'
A:横断面研究 B:队列研究 C:描述性研究 D:病例对照研究
AI参考:正确答案是B:队列研究。队列研究是根据时间方向划分，通过暴露因素追踪结局的研究。在暴露因素与结局之间存在因果关系的假设下，将暴露因素与结局变量随时间的变化进行追踪观察，以确定暴露因素是否为结局的效应因素及其效应大小。因此，本题答案为B选项。'
A:整群抽样 B:随机抽样 C:分层抽样 D:系统抽样
答案:正确答案:A
A:对阳性细胞数量统计 B:对细胞荧光强度评分 C:对黏连细胞数量进一步统计 D:对细胞核数量统计
答案:2AI参考:正确答案是A:对阳性细胞数量统计。Image Pro Plus是一款专业的图像分析软件，其Number Of Bins选项用于对免疫荧光图片中的阳性细胞数量进行统计。该选项可以将图片分为多个区间，分别统计每个区间的阳性细胞数量，以便对细胞进行定量分析。B、C、D选项均与Number Of Bins选项的作用不符，因此答案为A。'
A:Endnote软件 B:SPSS软件 C:Stata软件 D:Statistica软件
AI参考:正确答案是【Endnote软件】。Endnote是一款文献管理软件，不是常用的统计软件。常用的统计软件包括SPSS、Stata、Statistica等。'
A:65 B:33 C:54 D:50
AI参考:正确答案是C：54。ICGC数据库有54种癌症数据。ICGC（International Cancer Genome Consortium）是一个国际性的癌症基因组研究组织，收集了多种癌症的基因组数据，用于研究癌症的发生、发展、治疗等方面的信息。因此，选项C是正确答案。'
A:位图 B:矢量图 C:实验图 D:统计图
AI参考:正确答案是B：矢量图。矢量图是一种基于数学方程的图形格式，它可以通过改变方程来改变图形的大小和形状，而不会失真。因此，一般杂志要求无论如何放大都不会失真的图是矢量图。位图是由像素组成的图像，放大后会出现失真和模糊。实验图通常用于展示实验结果和数据，通常使用图表或图像来表示。统计图则用于展示数据的变化趋势和关系，通常使用条形图、折线图、饼图等图形来表示。因此，答案为B。'
A:相关性分析 B:线性回归 C:非线性拟合
AI参考:正确选项是C:非线性拟合。XY线图用于展示两个变量之间的关系，当数据分布不符合线性关系时，需要进行非线性拟合，通过图形和参数模型展示数据的特点和规律。在肿瘤生长速率的研究中，通常需要展示肿瘤生长的非线性特征，因此需要使用非线性拟合图表进行展示。而相关性分析用于衡量两个变量之间的线性关系强弱，线性回归用于预测因变量与自变量之间的线性关系，两者都不能很好地展示肿瘤生长的非线性特征。因此，本题的正确答案是C:非线性拟合。'
A:定类型数据 B:定序型数据 C:定值型数据 D:定距型数据
答案:定制型
A:0.01或0.1 B:0.05或0.1 C:0.01，0.05或0.1 D:0.05或0.01
AI参考:在进行单因素方差分析时，需选定置信度，即与I型错误发生概率相关的显著性水平α的值，通常可选择0.05或0.1。因此，正确答案是B：0.05或0.1。显著性水平α是用于衡量实验中偶然因素对实验结果的影响的参数，当实验结果与零假设之间的差异达到一定程度时，我们就认为这种差异是显著的。通常选择0.05或0.1作为显著性水平，但在某些情况下，可能需要更高的显著性水平，如0.01。因此，选项C也是合理的。综上所述，选项B和C是正确的。'
A:药物试验 B:人体试验 C:临床试验 D:临床药物试验
A:基因富集 B:突变位点鉴定 C:聚类分析 D:数据清洗
AI参考:正确答案是A:基因富集。ClusterProfiler是一个用于基因富集分析的R包，主要用于对基因集进行富集分析，分析基因与分子类别或基因之间在各种数据库中相互作用的方式和效果。B选项为另一个常用的包snprank，它主要提供基因突变位点的功能鉴定和分析，而不是聚类分析和数据清洗。C和D选项并不是单选题所需要的。因此，A选项是最适合题意的正确答案。'
A:GEO B:TCGA C:ICGC D:SEER
AI参考:正确答案是B:TCGA。临床数据库TCGA（The Cancer Genome Atlas）是一个用于研究癌症基因和表型的数据库，用于存储和分析关于癌症的基因和蛋白质数据。GEO（Gene Expression Omnibus）是一个用于存储基因表达数据的公共数据库，ICGC（International Cancer Genome Consortium）是一个国际性的癌症基因组研究组织，SEER（Surveillance, Epidemiology, and End Results）是一个用于监测癌症发病率和死亡率的国家数据库。因此，临床数据库最符合TCGA的特点。'
A:非线性拟合 B:线性回归 C:相关性分析
AI参考:正确选项是A:非线性拟合。在XY线图中，为了计算某药物的IC50，通常需要进行非线性拟合。IC50是指半数抑制浓度，表示药物在达到一半抑制效果时的浓度。在进行非线性拟合时，需要使用适当的拟合函数来描述药物浓度与响应之间的关系，并从中提取IC50的值。线性回归和相关性分析通常用于描述两个变量之间的线性关系，而不太适合用于计算IC50。因此，答案为A：非线性拟合。'
A:MsigDB B:GenoDB C:ImmuneDB D:CellDB
AI参考:正确选项是A:MsigDB。GSEA（基因集富集分析）是一种用于比较基因表达数据与预先定义的基因集的统计学方法，它使用MsigDB数据库作为基因集库。MsigDB（基因集注释数据库）是一个生物信息学数据库，提供了大量的基因集注释信息，包括基因集的功能、表达模式、相互作用等。因此，GSEA算法所使用的数据库是MsigDB。B、C、D选项都不是GSEA算法所使用的数据库。'
A:其他都可以 B:知网 C:Web of Science D:Pubmed
AI参考:正确选项是【C:Web of Science】。HistCite是一款文献计量分析工具，主要用于对引文数据进行分析，因此可以用来分析Web of Science数据库所导出的数据。知网、Pubmed和Pubmed等数据库的导出数据通常不适合使用HistCite进行分析。因此，其他选项（A）不正确。'
A:内参及目的蛋白条带的框选 B:对定量结果分组进行统计分析 C:利用内参蛋白对目的蛋白进行校正 D:绘制山峰图进行定量
A:Prism B:HistCite C:Origin D:VOSviewer
AI参考:正确选项为【B:HistCite D:VOSviewer】。文献分析软件包括HistCite和VOSviewer。HistCite是一款用于文献计量分析和引文分析的软件，可以快速生成文献的h指数、参考文献、共引分析等数据。VOSviewer则是一款用于社会网络分析和知识可视化的软件，可以用于分析文献之间的引用关系、关键词共现等。Prism主要用于基因、微生物、化学物质等生物学实验相关数据的图表展示和统计分析，Origin则是一款强大的数据分析和绘图软件。'
A:对不同组织的肿瘤和正常组织进行测序数据和临床资料对比 B:探究临床数据和基因组学数据之间的关系 C:根据基因组数据建立不同的亚组 D:KM算法进行生存分析和生存曲线的绘制
AI参考:XENA的功能包包括：B,C,D因此，XENA的功能包可以探究临床数据和基因组学数据之间的关系，根据基因组数据建立不同的亚组，以及KM算法进行生存分析和生存曲线的绘制。A选项虽然提到了测序数据和临床资料对比，但这并不是XENA的主要功能。'
A:正态分布 B:F分布 C:标准正态分布 D:t分布
AI参考:正确答案是：A:正态分布 C:标准正态分布。正态分布和标准正态分布是以0为中心单峰分布。故正确答案为AC。'
A:PolyPhen B:VEP C:Missdamage D:SIFT
A:单样本t检验、 B:成组t检验 C:配对t检验 D:单因素方差分析
AI参考:单维度分组柱形图可以使用统计学方法为：单因素方差分析、成组t检验。单因素方差分析常用于多组间的比较，可以用于分析多个样本之间的差异。而成组t检验常用于两组独立样本的比较，可以用于分析两个样本之间的差异。因此，这两个方法都是适合用于单维度分组柱形图的统计学方法。单样本t检验主要用于单个样本与某一标准或参考值之间的比较，而这个标准或参考值通常是已知的，因此它不适合用于单维度分组柱形图的分析。配对t检验主要用于同一组内两个样本的比较，这与柱形图展示的是不同组间的数据是有差异的。因此，正确选项为B：成组t检验 和 D：单因素方差分析。'
A:绘制生存率图 B:简单的统计 C:绘制折线图 D:文字处理
AI参考:正确选项为：A:绘制生存率图、C:绘制折线图。GraphPadPrism是一款专业的医学统计软件，主要用于简单的统计分析和绘制折线图、生存率图等。B选项虽然简单，但不是GraphPadPrism的主要功能。D选项文字处理与GraphPadPrism的功能不符。因此，正确答案是A和C。'
A:DEseq2 B:limma C:edgeR D:pheatmap
AI参考:正确选项为：A:DEseq2 C:edgeR差异分析的R包包括DESeq2和edgeR，这两个包主要用于差异基因表达分析。limma主要用于差异蛋白质表达分析，而pheatmap用于绘制差异表达数据的热图。因此，选项B和D不是差异分析的R包。'
A:DEseq2 B:limma C:pheatmap D:edgeR
AI参考:正确选项为：A:DEseq2 B:limma D:edgeR。差异分析的R包包括DESeq2、limma和edgeR，其中DESeq2主要用于差异基因的表达分析，limma主要用于差异蛋白质的表达分析，而edgeR主要用于差异转录本的表达分析。Pheatmap主要用于绘制差异表达数据的热图和条形图，与差异分析无关。因此，答案为A、B、D。'
A:能够通过计算p值来比较差异是否具有显著性 B:使定型结果转化为可统计分析的定量结果 C:使实验结果更加显著 D:使实验结果更加准确
A:单因素方差分析 B:多因素方差分析 C:无重复的双因素方差分析 D:重复的双因素方差分析
AI参考:答案是：A:单因素方差分析 C:无重复的双因素方差分析。Excel中的方差分析工具提供了单因素方差分析、无重复双因素方差分析和无重复双因素方差分析这三种不同类型。解释：* 单因素方差分析：只有一个自变量，用于比较不同组之间的差异。* 无重复双因素方差分析：有两个或多个自变量，但在同一组内没有重复的数据点。例如，两个因素分别控制了两组数据，这两组数据在同一个条件下进行实验，但没有相同的实验条件。* 重复双因素方差分析：有两个或多个自变量，每个自变量在不同组内的数据点是重复的。例如，两组数据在不同的条件下进行实验，并且每个条件下的数据点是重复的。因此，选项B和D都是正确的，但题目中只要求选择正确的选项，所以答案为AC。'
A:Sigmaplot B:Origin C:Excel D:Graphpad prism
AI参考:在目前国际杂志发表的论文中，约80%的图片出自Sigmaplot、Origin和Graphpad prism这三个专业图表设计软件。'
A:SIFT B:PolyPhen C:Missdamage D:VEP
A:代码编辑窗口 B:命令执行窗口 C:变量浏览窗口 D:文件管理窗口
AI参考:正确选项是【ABCD】。RStudio是一款用于R编程的集成开发环境（IDE），它包括代码编辑窗口、命令执行窗口、变量浏览窗口和文件管理窗口等基本界面元素。这些元素为R编程提供了便利和高效的环境。'
A:Photoshop B:Image J C:Graphpad prism D:Image pro plus
AI参考:正确选项是【ABD】。本课程主要介绍了Photoshop和Image J这两种图片处理及分析软件的应用，而Graphpad prism和Image pro plus虽然也是常用的生物医学图像分析软件，但在本课程中并未详细介绍。Photoshop是一款功能强大的图像编辑软件，可以用于图片的编辑、合成、调整色彩、尺寸、旋转等操作。Image J则是一款免费的开源软件，可以用于对图像进行测量、分析、统计等操作。'
A:HillSlope B:Top C:IC50 D:Bottom
AI参考:正确选项为【A:HillSlope 、B:Top、C:IC50】。IC50是半数抑制浓度，是药物在体外或体内产生50%最大效应时的药物浓度。HillSlope 是表示药物浓度与效应之间的关系曲线坡度的一个参数。Top是药物浓度与效应之间的关系曲线的最高点。Bottom则是浓度与效应之间的关系曲线的最低点。在计算药物的IC50时，需要这四个参数，其中HillSlope反映了药物浓度与效应之间关系的斜率，因此是计算IC50时的重要参数之一。'
A:方差分析 B:Wilcoxon秩和检验 C:卡方检验 D:T检验
AI参考:正确选项为D:T检验。在进行患者的基线数据比较时，常用的两组间比较方法是T检验。T检验包括配对T检验和独立T检验，适用于计量资料两组间比较，可以比较两个独立样本的均值是否相等。因此，选项D是正确答案。其他选项如方差分析、Wilcoxon秩和检验、卡方检验等也常用于数据比较，但它们的使用条件和范围可能有所不同。'
A:图表样式改变 B:更改图表类型 C:字体进行美化修饰 D:进行图表布局更改
AI参考:根据常规的Excel操作知识，点击选中的图表后，单机菜单栏的“设计”，可以进行以下操作：A: 图表样式改变 B: 更改图表类型 C: 字体进行美化修饰所以，这三个选项都是可以进行的操作。D选项“进行图表布局更改”通常是在设计图表完成后进行的操作，而不是在设计阶段进行的。所以，正确答案是A、B、C。'
A:队列比较 B:富集分析 C:Venn图 D:临床数据分析
AI参考:正确选项为B、C、D。分析功能包括富集分析、Venn图、临床数据分析等。富集分析用于识别基因组中与特定生物标志物或疾病相关的潜在机制，Venn图用于展示样本之间的共同点和差异点，而临床数据分析则涉及对患者的各种数据进行分析，以了解疾病的发生、发展、预后等情况。因此，选项B、C、D都是TCGA的分析功能。而选项A中的队列比较主要用于比较不同队列之间的差异，与TCGA的分析功能不完全相符。'
A:图片简化 B:改变展示方式 C:图片美化 D:信息提取
AI参考:正确选项为：A、图片简化；C、图片美化；D、信息提取。图片处理分析主要包括图片简化、改变展示方式、信息提取和图片美化等。其中，图片简化是将复杂的图片进行简化处理，使其更易于理解和识别；改变展示方式则是指通过调整图片的色彩、对比度、亮度等参数，使其更符合特定的展示需求；信息提取则是从图片中提取出关键信息，如文字、图像、颜色等，以便更好地理解和使用；图片美化则是通过调整图片的色彩、对比度、亮度等参数，使其更加美观。因此，本题答案为A、C、D。'
A:对 B:错
AI参考:答案是A：对。图片处理分析通常是为了从图片中提取相关数据并进行统计分析。图片可以被视为一种数据源，通过图像处理技术可以识别、分析和提取其中的信息，例如文字、颜色、形状、纹理等，以便进行进一步的数据分析。因此，这个判断题的答案是A。'
A:对 B:错
AI参考:答案：B.错。TGCA数据库不包括TARGET数据库。题干中描述的两者之间的关系是不正确的。'
A:错 B:对
AI参考:答案是B：对。NHANES（全国健康与营养调查）是一项大规模的调查项目，旨在收集美国和世界各地居民的健康和营养信息。它不专门针对中国家庭人口健康和营养的信息进行收集。因此，选项A是错误的，而选项B是正确的。'
A:对 B:错
AI参考:答案是B:错。免疫荧光染色分析的优势在于能够同时对多个蛋白进行免疫荧光染色，但在统计分析方面可能存在一定的限制，通常需要手动进行统计，而非自动化统计分析。因此，免疫荧光染色分析在统计分析方面的优势并不明显，不能同时对多个蛋白进行统计分析。'
A:对 B:错
AI参考:答案是B：错。GraphPad是一种用于生成和编辑图表的数据分析工具，可以修改生成图表的颜色。因此，这个判断题的正确答案是B，即GraphPad可以修改生成图表的颜色。'
A:错 B:对
AI参考:正确答案是B：对。相关性分析需要计算R值和P值，用来衡量变量之间的线性关系以及这种关系在统计学上的显著性。因此，这个说法是错误的。'
A:对 B:错
A:对 B:错
A:错 B:对
AI参考:B:对。EndNote主要用于插入引文，它是一种常用的文献管理工具，可以帮助用户管理文献引用，并方便地插入到论文中。'
A:错 B:对
AI参考:正确答案是B：对。接收者操作特征曲线（ROC曲线）是评估预测因素在特定灵敏度下特异度与1-特异度之间关系的曲线，常用于预测因素在临床诊断价值中的准确性分析。因此，在进行某个预测因素的临床诊断价值的准确性分析时，接收者操作特征曲线即ROC曲线则是最常用的一种分析方法，此题为判断题，所以答案为B：对。'
