第三章 CADD的今生:计算机辅助药物设计是一门实践性极强的课程,本章主要讲解药物设计软件SYBYL的基本操作以及CADD四大模块:定量构效关系,分子对接,药效团模型及同源模建,并针对四大模块的定义理论、方法学进行授课,同时对四大模块的软件使用进行展示。3.1CADD的神兵利剑:本节课程起正式学习计算机辅助药物设计的四大模块及相应地软件操作,熟悉软件基本操作有助于理解专业理论知识。
3.2CADD四大护法之定量构效关系:本课程主要讲授计算机辅助药物设计四大理论第一理论-定量构效关系的理论知识,方法学及相应的软件操作。
3.3CADD四大护法之分子对接:本课程主要讲授计算机辅助药物设计四大理论第二理论-分子对接的理论知识,方法学及相应的软件操作。
3.4CADD四大护法之药效团:本课程主要讲授计算机辅助药物设计四大理论第三理论-药效团的理论知识,方法学及相应的软件操作。
3.5CADD的四大护法之同源模建:本课程主要讲授计算机辅助药物设计四大理论第四理论-同源模建的理论知识,方法学及相应的软件操作。
[单选题]建立QSAR模型,最常用的就是
最小二乘法
sample法
偏最小二乘法
单纯型算法
答案:偏最小二乘法
[多选题]下列哪些是定量构效关系CoMFA方法用到的参数
电性参数
立体参数
疏水性参数
指示变量
结构参数[判断题]分子场分析法假定配基与受体的结合是共价的,两者的亲和力或配基的生物活性与配基分子周围的空间立体场或静电场有关。

[单选题]分子对接分类中适合考察比较大的体系是
半刚体对接
半柔性对接
柔性对接
刚体对接[判断题]药物与受体的结合强度取决于结合的自由能变化

[单选题]分子对接方式中,不用考虑分子结构特性的是
半柔性对接
柔性对接
半刚性对接
刚性对接[多选题]对接方法尚需解决的问题
分子的柔性
溶剂化效应
构象选择
打分函数[单选题]药效团模型可以通过什么方法来模拟配体分子的活性构象,并据此来推断和解释受体与配体分子之间可能的作用模式。
构象搜索和分子叠合
相似活性基团类比
分子结构能量优化对比
功能团聚类分析[判断题]sp2 或sp3 杂化的氧原子都属于氢键受体。

[单选题]一个蛋白质的结构是由其_____唯一决定的,通过已知一级结构,理论上足以获取二级和三级结构。
氢键数量
氨基酸序列
二硫键位置
立体特性[判断题]序列比对的结果可以作为两者之间一定存在同源关系的依据

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