第三章 序列比对与进化树:本章节介绍序列比对与进化树的知识,内容包括:两两序列比对、多序列比对、进化树3.1序列两两比对:两两序列比对简介、比对方法
3.2多序列比对:多序列比对背景简介和比对方法
3.3进化树:进化树简介和构建方法
3.1序列两两比对:两两序列比对简介、比对方法
3.2多序列比对:多序列比对背景简介和比对方法
3.3进化树:进化树简介和构建方法
[单选题]以下哪个蛋白质的理化性质是ProtParam无法提供的?

选项:[分子量, 氨基酸组成, 等电点, 二级结构]
[单选题]蛋白质跨膜区主要是有亲水性氨基酸组成的。

选项:[错, 对]
[单选题]以下哪种结构单元不属于蛋白质的二级结构?

选项:[无规则卷曲, alpha-螺旋, beta-折叠, 茎(stem)结构]
[单选题]PSIPRED是用于蛋白质二级结构预测的软件。

选项:[对, 错]
[单选题]在二级结构预测中,往往要求预测二级结构的置信度要达到5以上,预测的结果才是比较可信的。

选项:[错, 对]
[多选题]以下哪些方法可以用于三级结构预测?

选项:[引线法(穿线法), 从头预测法, 归纳法, 同源建模法]
[单选题]从头预测法是已知蛋白质三维结构预测中计算量最小的一种。

选项:[错, 对]
[单选题]以下哪种蛋白质三维结构预测方法是最准确的?

选项:[引线法, 从头预测法, 二级结构法, 同源建模法]
[多选题]在同源建模法预测蛋白质三维结构过程中包括以下哪些步骤?

选项:[计算分子量, 选取合适的模板, 构建三维结构, 目的蛋白质跟蛋白质结构数据库中的蛋白质进行同源序列比对]
[多选题]以下哪些结构属于RNA的二级结构?

选项:[环状结构(loop), beta-折叠, 茎状结构(stem), alpha-螺旋]
[单选题]全局序列比对用于整体相似性程度较低、在较小区域内有局部相似性的两个序列比对。

选项:[对, 错]
[多选题]以下哪些属于蛋白质打分矩阵?

选项:[疏水矩阵, 遗传密码矩阵, BLOSUM矩阵, PAM矩阵]
[单选题]传统的基于动态规划的局部性比对性算法采用的是精确的序列比对,虽然有着较好的比较结果,但是算法的时间复杂度较高。

选项:[错, 对]
[单选题]在蛋白质数据库中比对蛋白质序列,需要选择一下那种blast模式?

选项:[tblastn, blastn, blastx, blastp]
[单选题]多序列比对就是两条以上的序列进行比对,可以用于进化树分析、寻找保守区域等。

选项:[对, 错]

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