第四章 核酸序列分析:本章节介绍核酸序列分析的知识,内容包括:DNA序列分析的意义、基因结构分析4.1DNA序列分析的意义:DNA序列分析的意义
4.2基因结构分析:基因结构分析
4.1DNA序列分析的意义:DNA序列分析的意义
4.2基因结构分析:基因结构分析
[多选题]基因的预测软件主要有

选项:[GENOMESCAN, CpGPlot, Promoterscan, GENSCAN]
[单选题]基因结构的预测是基因组测序后的最重要一个步骤,真核生物和原核生物因为密码子表的不同,方法会有所不同。各种预测方法得到的结果也有所不同

选项:[错, 对]
[单选题]CpG岛指的是一段()bp长度的DNA序列,G+C含量达到()以上,与基因的存在相关性达到60-80%以上 

选项:[200,50, 50,50, 500,70, 100,25]
[多选题]CodonW是密码子偏好性分析软件,以下哪些功能可以用该软件分析

选项:[最优密码子使用频率, 密码子适应指数, 密码子偏性指数, 有效密码子数]
[单选题]随着链特异性转录组测序技术等的大量应用,为基因的鉴定提供了一个更为直接的工具和数据库

选项:[对, 错]
[多选题]常见的蛋白质得分矩阵有

选项:[等价矩阵, BLOSUM矩阵    , 转换颠换矩阵, PAM矩阵]
[单选题]BLOSUM矩阵。后边的数字越大,就说明他的序列一致性更高,它们的亲缘关系越近,这样的得分矩阵适合应用在亲缘关系较近的蛋白质序列分析中。

选项:[错, 对]
[多选题]以下哪些选项可以体现序列比对的重要意义?

选项:[我们可以通过多个序列的比对,来了解这样一个同源基因家族,他们所具备的共同特征, 序列比对可以用来调查基因的基因的多态性情况, 序列比对可以用来寻找和确定同源基因,以及帮助确定基因的功能, 我们可以通过同源基因之间相似度的差异,来进行推断它们的亲缘关系,构建这些同源基因演化的历史]
[多选题]进行序列比对需要的两个要素是

选项:[序列长度, 得分矩阵    , 比对算法, 物种信息]
[单选题]空位罚分的方法中,哪种是更有生物学意义的罚分方法?

选项:[每个空位减1分, 线性罚分, 空位不减分, 仿射罚分]
[单选题]如果我们要研究亲缘关系比较近的一些蛋白质,我们就需要用PAM后面数字 ( ) 的这种矩阵

选项:[大, 无所谓
, 小, 200
]
[单选题]如果查询序列是蛋白质,数据库是核酸序列,应该用哪种BLAST程序?

选项:[BLASTX, BLASTP, TBLASTN, BLASTN]

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