第六章 蛋白质结构预测和分子设计:本章节介绍蛋白质结构预测和分子模拟的常用方法,内容包括:蛋白质结构预测、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、生物网络分析6.1蛋白质结构预测:蛋白质一级、二级、三级结构预测
6.2同源建模:同源建模原理及步骤、预测软件、结构可视化工具
6.3分子对接:分子对接原理、案例分析
6.4分子动力学模拟:分子动力学模拟简介及应用
6.5生物网络分析:图论简介、生物分子网络类型及应用
6.1蛋白质结构预测:蛋白质一级、二级、三级结构预测
6.2同源建模:同源建模原理及步骤、预测软件、结构可视化工具
6.3分子对接:分子对接原理、案例分析
6.4分子动力学模拟:分子动力学模拟简介及应用
6.5生物网络分析:图论简介、生物分子网络类型及应用
[单选题]第一代测序的发明者是:

选项:[Watson, Sanger, Gilbert, Morgan]
[单选题]下列哪项不是illumina二代测序文库构建的目的:

选项:[制备适合上机测序长度的片段, 给待测DNA片段添加接头引物, 给待测DNA模板添加带荧光标记的dNTP, 适度扩增使待测文库符合上机浓度要求]
[单选题]与第二代illumina比较,第三代Pacbio测序技术的优点是:

选项:[测序费用低, 测序通量高, 测序准确度高, 测序读长较长]
[单选题]下列哪项测序技术没有用到荧光标记的脱氧核糖核苷酸?

选项:[第一代测序技术, 第三代Oxford Nanopore 测序技术, 第三代Pacbio测序技术, 第二代illumina测序技术]
[单选题]下面哪项全基因组甲基化研究方法在检测前引入了碱基突变:

选项:[甲基化DNA免疫沉淀技术, 重亚硫酸盐转化全基因组测序法
, 甲基化位点免疫共沉淀技术, 甲基化敏感酶消化法]
[单选题]10x Genomics Chromium单细胞建库系统无需根据细胞表面标志物对细胞进行分离。

选项:[对, 错]
[单选题]在进行真核mRNA转录组建库时,我们是利用了mRNA哪项特征对其进行捕获:

选项:[甲基化修饰, 3’ polyA, 乙酰化修饰, 5’帽子结构]
[单选题]SMART技术的核心是利用SMARTScribe逆转录酶具有自动模板转换的功能,在一个反应内就可以完成带有接头序列的第一链cDNA合成

选项:[对, 错]
[单选题]SiRNA的作用方式为与靶基因严格互补配对,而miRNA在植物中通常允许1-2个碱基的错配。

选项:[对, 错]
[单选题]下面关于泛基因组的描述错误的是:

选项:[泛基因组即某一物种全部基因的总称,包括核心基因组和非必须基因组, 非必须基因组与物种特定环境的适应性有关,反应了物种的特异性, 核心基因组与物种的主要表型相关,反应了物种的稳定性, 进行泛基因组研究时需要对每个个体都精确测序]
[多选题]UniProt数据库整合了哪三大数据库资源?

选项:[Swiss-Prot, KEGG, PIR-PSD, TrEMBL]
[单选题]以下哪项参数无法通过一级序列的理化性质计算获得?

选项:[相对分子质量, 进化关系, 消光系数, 等电点]
[单选题]疏水作用力是蛋白质折叠的主要驱动力,氨基酸亲疏水性等分析为高级结构预测提供参。

选项:[对, 错]
[单选题]PDB数据库中同时包含了利用实验解析和计算模拟的生物大分子的三维结构信息。

选项:[错, 对]
[多选题]蛋白质三维结构预测的方法包括哪些?

选项:[序列比对, 从头预测, 同源建模, 折叠识别]
[单选题]利用计算手段预测的蛋白质三维结构能达到很高的准确性,不需要再进行优化了。

选项:[对, 错]
[单选题]以下关于同源建模的说法中,表述错误的是()?

选项:[同源建模的理论基础是一级序列相似的蛋白质,其三维结构也相似, 同源建模时需要进行序列比对分析模板序列与目标序列之间的异同, 同源建模时只能选择一个结构作为模板来建模, 建模过程中需要对整体结构进行优化并进行合理性检测]
[单选题]以下分子力场中,不属于非键作用的是()?

选项:[键的伸缩, 静电相互作用, 氢键相互作用, 范德华相互作用]
[多选题]分子对接可以分为哪几种类型?

选项:[刚性对接, 柔性对接, 半柔性对接, 半刚性对接]
[单选题]分子动力学模拟可以获得蛋白质在溶液中一段时间内的运动情况,但是消耗计算资源。

选项:[对, 错]

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