第八章 拓展学习：本章节介绍一些生物信息学的拓展知识，内容包括：R语言简介、Linux系统简介、David Baker专题介绍、George Church专题介绍8.1R语言简介:R语言简介、R程序包[单选题]系统生物学是在系统层面上研究生命现象的一门学科，最基本的模型是网络模型。选项:[错, 对]
8.2Linux系统简介:Linux起源、版特点及应用
8.3David Baker专题介绍:David Baker专题介绍
8.4George Church专题介绍:George Church专题介绍
8.1R语言简介:R语言简介、R程序包
8.2Linux系统简介:Linux起源、版特点及应用
8.3David Baker专题介绍:David Baker专题介绍
8.4George Church专题介绍:George Church专题介绍
[多选题]以下哪些属于生物网络？选项:[信号转导网络, 蛋白质互作网络, 代谢网络, 基因调控网络]
[单选题]在代谢网络中，每一个节点代表一个（）？选项:[基因, 代谢物, 酶, 反应]
[单选题]网络可以分为有向网络和无向网络，生物网络都是无向网络。选项:[错, 对]
[多选题]R是生物信息分析中非常重要的工具，可以实现以下哪些功能？选项:[测序数据分析, 进化树分析, 生态学数据分析, 聚类分析]
[单选题]R语言中，需要安装软件包时需要调用的命令是（）？选项:[library(), install.packages(), help(), require()]
[单选题]利用R可以绘制并分析基因芯片数据的火山图来显示差异基因及p-value。选项:[错, 对]
[多选题]在生物信息学研究中使用Linux系统的优势在于？选项:[Linux系统支持多种平台，并且不断更新, Linux系统是免费的, Linux系统支持集群计算机的使用, Linux系统是科学研究的通用平台]
[单选题]Linux系统非常独立，不能在Windows下运行Linux环境。选项:[对, 错]
[单选题]Linux是一款免费的操作系统，用户可以通过网络或其他途径免费获得，并可以任意修改其源代码。选项:[对, 错]
[多选题]用于转录组检测的技术包括：选项:[微阵列(microarray)技术, 克隆PCR, 定量PCR, 转录组测序]
[单选题]可以用来对转录组测序数据的质量进行检查的工具是：
选项:[内容已经隐藏，点击付费后查看
[单选题]受到基因长度不同和测序深度不同的影响，不能直接使用RNAseq结果中的原始的基因counts 数目，来衡量转录组测序的基因表达量。选项:[对, 错]
[单选题]同一样品内，两基因的FPKM的比值与TPM的比值相等。选项:[对, 错]
[单选题]关于R语言的描述，不正确的是：
选项:[可以直接导入文件中的数据, 有些转录组分析的工具是R程序包, 可以用R绘统计图, 只能安装在大型服务器上]
[单选题]若希望通过聚类分析，将究对象按照相似性用树形图进行呈现，通常选用哪种聚类：
选项:[层次聚类, 火山图聚类, 大小聚类, K均值聚类]
[多选题]转录组注释可以使用的方法有：选项:[同源重组, 同源查询, 根据已知的基因结构预测（预测ORF）, 根据序列长度预测]
[单选题]无法使用R语言来进行聚类分析选项:[对, 错]
[单选题]可以用来寻找样品间的差异表达基因的工具有：
选项:[edgrR
, Trinity
, FPKM
, TPM
]
[多选题]常用的收录高质量参考基因组序列的数据库包括：（）选项:[Ensembl, KEGG, Gene Ontology, NCBI]
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