生物信息学（山东联盟）_智慧树知到答案2021年

第四章 DNA与蛋白质序列比对：本章包括序列比对基础、双序列比对和多序列比对。4.1序列比对基础:本节包括序列比对的分类、序列比对的相似性、相似和距离的定量描述、核酸和蛋白质替换计分矩阵。
4.2双序列比对:本节包括点阵序列比较原理和应用、动态规划算法全局比对和实例、动态规划算法局部比对和实例介绍。
4.3BLAST介绍:本节主要介绍BLAST算法、NCBI的BLAST基本流程、PSI和PHIBLAST简介、专门的BLAST和本地BLAST。
4.4多序列比对:本节主要介绍多序列比对。多序列比对，就是三条以上序列的比对。是通过一定的算法，对一组核酸和蛋白质序列按照一定的规律排列起来，比较这组序列的异同。
4.1序列比对基础:本节包括序列比对的分类、序列比对的相似性、相似和距离的定量描述、核酸和蛋白质替换计分矩阵。
4.2双序列比对:本节包括点阵序列比较原理和应用、动态规划算法全局比对和实例、动态规划算法局部比对和实例介绍。
4.3BLAST介绍:本节主要介绍BLAST算法、NCBI的BLAST基本流程、PSI和PHIBLAST简介、专门的BLAST和本地BLAST。
4.4多序列比对:本节主要介绍多序列比对。多序列比对，就是三条以上序列的比对。是通过一定的算法，对一组核酸和蛋白质序列按照一定的规律排列起来，比较这组序列的异同。

[单选题]替换的编辑操作可以用以下哪个来表示？

选项:[Insert, Replace, Match, Delete]
[单选题]对于约95%保守的序列，blastn程序的计分参数调整区最好选用以下哪个

选项:[匹配是得1分,错配是-2, 匹配是得1分,错配是0, 匹配是得1分,错配是-1, 匹配是得1分,错配是-3]
[单选题]下面哪个程序，可以用来搜索序列GATCCGGAAG的相似序列。

选项:[blastx, blastn, blastp, tblastn]
[单选题]在蛋白质的BLAST程序中，PSI-BLAST指的是（  ）

选项:[动态规划算法全局比对, 位点特异的迭代BLAST, 模式识别迭代BLAST, 基本的局部序列比对搜索工具]
[单选题]下列各项中能进行蛋白质和蛋白质之间的相似性比较的软件有（）

选项:[Blastp, Blastx, Blastn, Tblstn]
[多选题]下列选项中，属于蛋白质的计分矩阵的有（）

选项:[PAM250, BLAST, PAM1, BLUSUM62]
[单选题]在蛋白质序列比对中，两种氨基酸之间的替换在自然界中越容易发生，则这种替换在计分矩阵中对应的数值越大。

选项:[错误, 正确]
[单选题]假设蛋白质序列相似度在20%左右，那么比对时应该采用的PAM矩阵是（  ）

选项:[PAM80, PAM60, PAM250, PAM20]
[单选题]将序列AAG和AGC进行双序列动态规划算法的局部比对,空位罚分为‐5,打分矩阵如下。回答下列比对中格子①②③中的值是下面哪个选项(    )

选项:[2；2；4, 2；2；2, 2；4；2, 2；4；4]
[单选题]在进行双序列比对时,可以通过减小空位罚分来实现序列中不出现空位。

选项:[错, 对]
[多选题]下列选项中，属于蛋白质的计分矩阵的有（）

选项:[PAM250, BLAST, PAM1, BLUSUM62]
[单选题]在蛋白质序列比对中，两种氨基酸之间的替换在自然界中越容易发生，则这种替换在计分矩阵中对应的数值越大。

选项:[正确, 错误]
[单选题]下列各项中能进行蛋白质和蛋白质之间的相似性比较的软件有（）

选项:[Blastp, Blastn, Blastx, Tblstn]
[单选题]假设蛋白质序列相似度在20%左右，那么比对时应该采用的PAM矩阵是（  ）

选项:[PAM250, PAM80, PAM20, PAM60]
[单选题]在蛋白质的BLAST程序中，PSI-BLAST指的是（  ）

选项:[位点特异的迭代BLAST, 基本的局部序列比对搜索工具, 模式识别迭代BLAST, 动态规划算法全局比对]
[单选题]下面哪个程序，可以用来搜索序列GATCCGGAAG的相似序列。

选项:[tblastn, blastp, blastx, blastn]
[单选题]对于约95%保守的序列，blastn程序的计分参数调整区最好选用以下哪个

选项:[匹配是得1分,错配是0, 匹配是得1分,错配是-1, 匹配是得1分,错配是-2, 匹配是得1分,错配是-3]
[单选题]替换的编辑操作可以用以下哪个来表示？

选项:[Delete, Match, Insert, Replace]
[单选题]将序列AAG和AGC进行双序列动态规划算法的局部比对,空位罚分为‐5,打分矩阵如下。回答下列比对中格子①②③中的值是下面哪个选项(    )

选项:[2；2；4, 2；4；2, 2；2；2, 2；4；4]
[单选题]在进行双序列比对时,可以通过减小空位罚分来实现序列中不出现空位。

选项:[错, 对]