第五章 序列特征分析:本章包括DNA序列特征分析、蛋白质序列特征分析和 RNA序列特征分析。5.1DNA序列特征分析:本节包括DNA序列特征分析、蛋白质序列特征分析、RNA序列特征分析。
5.2蛋白质序列特征分析:本节包括蛋白质序列的基本信息分析、蛋白质序列的特征信息分析、蛋白质序列的功能信息分析。
5.3RNA序列与结构特征分析:本节包括RNA的序列特征、RNA的结构特征以及RNA结构预测的在线资源与软件。
5.4常用软件操作:本节包括Primer 5.0的使用、DNAMAN制作质粒图谱、如何使用DNAMAN软件进行序列拼接。
5.1DNA序列特征分析:本节包括DNA序列特征分析、蛋白质序列特征分析、RNA序列特征分析。
5.2蛋白质序列特征分析:本节包括蛋白质序列的基本信息分析、蛋白质序列的特征信息分析、蛋白质序列的功能信息分析。
5.3RNA序列与结构特征分析:本节包括RNA的序列特征、RNA的结构特征以及RNA结构预测的在线资源与软件。
5.4常用软件操作:本节包括Primer 5.0的使用、DNAMAN制作质粒图谱、如何使用DNAMAN软件进行序列拼接。
[单选题]原核基因识别任务的重点是识别开放阅读框。

选项:[错, 对]
[单选题]下列软件中,不能用于进行碱基组成分析的是(  ) 

选项:[DNAMAN, GENSCAN, BioEdit, DNASTAR]
[单选题]下列选项中,没有密码子偏好性的是哪一个?

选项:[RSCU值>1, RSCU值=1, CAI值=1, RSCU值<1]
[单选题]GC含量高的DNA比GC含量低的DNA更加不稳定。

选项:[错, 对]
[单选题]从一条核酸序列转变为另一条核酸序列所需要的变换越多,这两条序列的相关性就越大,进化距离就越小,从共同祖先分歧的时间就越晚。

选项:[错, 对]
[单选题]下列选项中哪个是蛋白质磷酸化位点分析的主要位点?

选项:[丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸, 丝氨酸,甘氨酸,酪氨酸, 亮氨酸,苏氨酸,丙氨酸, 甘氨酸,色氨酸,酪氨酸]
[单选题]蛋白质的信号肽分析工具有许多,下列不属于信号肽分析工具的是哪一个?

选项:[EMBL, SigCleave, Phobius, Signal-BLAST]
[单选题]在蛋白质的合成过程中,同义密码子的使用概率是不同的。

选项:[对, 错]
[单选题]在PCR引物设计中,上下游引物的Tm值越接近越好,引物5′端不能修饰,3′端可以修饰。

选项:[错, 对]
[多选题]假如你要用原核表达载体pET28a质粒表达一个蛋白,该蛋白的基因CDS如下:>ORF
ATGAACGCTACACACTGCATCTTGGCTTTGCAGCTCTTCCTCATGGCTGTTTCTGGCTGTTACTGCCACG
TGTTGCCGGAATTCAGCCTCAGGAAGCGGAAAAGGAGTCGCTGCTGA酶切位点分析可以用DNAMAN,或在线工具网址:http://nc2.neb.com/NEBcutter2/index.php通过在PCR引物5’端加入酶切位点,扩增该片段后,PCR产物经双酶切接入pET28a载体的多克隆位点(MCS)区,载体MCS区序列如下:

MCS.png

在设计PCR引物时,如果下游引物5’ 端加入的酶切位点是XhoI,上游引物5’ 端理论上可以加入酶切位点有()

选项:[Sal I, HindIII, BamHI, SacI, NotI, EcoRI]
[单选题]下列选项中哪个是蛋白质磷酸化位点分析的主要位点?

选项:[丝氨酸,甘氨酸,酪氨酸, 甘氨酸,色氨酸,酪氨酸, 亮氨酸,苏氨酸,丙氨酸, 丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸]
[单选题]下列选项中,没有密码子偏好性的是哪一个?

选项:[RSCU值>1, RSCU值=1, RSCU值<1, CAI值=1]
[单选题]蛋白质的信号肽分析工具有许多,下列不属于信号肽分析工具的是哪一个?

选项:[EMBL, Signal-BLAST, SigCleave, Phobius]
[单选题]下列软件中,不能用于进行碱基组成分析的是(  ) 

选项:[DNAMAN, DNASTAR, BioEdit, GENSCAN]
[单选题]从一条核酸序列转变为另一条核酸序列所需要的变换越多,这两条序列的相关性就越大,进化距离就越小,从共同祖先分歧的时间就越晚。

选项:[错, 对]
[单选题]在蛋白质的合成过程中,同义密码子的使用概率是不同的。

选项:[对, 错]
[单选题]在PCR引物设计中,上下游引物的Tm值越接近越好,引物5′端不能修饰,3′端可以修饰。

选项:[对, 错]
[单选题]GC含量高的DNA比GC含量低的DNA更加不稳定。

选项:[错, 对]
[多选题]假如你要用原核表达载体pET28a质粒表达一个蛋白,该蛋白的基因CDS如下:>ORF
ATGAACGCTACACACTGCATCTTGGCTTTGCAGCTCTTCCTCATGGCTGTTTCTGGCTGTTACTGCCACG
TGTTGCCGGAATTCAGCCTCAGGAAGCGGAAAAGGAGTCGCTGCTGA酶切位点分析可以用DNAMAN,或在线工具网址:http://nc2.neb.com/NEBcutter2/index.php通过在PCR引物5’端加入酶切位点,扩增该片段后,PCR产物经双酶切接入pET28a载体的多克隆位点(MCS)区,载体MCS区序列如下:

MCS.png

在设计PCR引物时,如果下游引物5’ 端加入的酶切位点是XhoI,上游引物5’ 端理论上可以加入酶切位点有()

选项:[HindIII, EcoRI, Sal I, NotI, BamHI, SacI]
[单选题]原核基因识别任务的重点是识别开放阅读框。

选项:[对, 错]

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